生化分子趣味专辑:生化II复习视角.pdfVIP

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生化II之分子专辑

生命科学学院

2011-12-24

编者按——

对有机化学、分子机理以及构效关系有着强烈的人,复

习生化时可能不会只从各种生化途径入手。不管如何,分子也算是另

一种角度。该“专辑”走的明显不是严格的学术路线,而是希望尽可

能把编者认为的生化有趣好玩的一面展示给读者。视其为一本花边杂

志,于复习苦闷之余,翻翻无妨。鉴于编者能力有限,知识性错误在

所难免,欢迎指正。ǩƒ†‹•ˆ”—–ƒ•!

目录

硫胺焦磷酸素

生物素

丙二酰辅酶

磷酸吡哆醛

氨基甲酰磷酸

硫辛酸

维生素,钴胺素

卟啉

磷酸核糖焦磷酸

次黄嘌呤

四氢叶酸

腺苷甲硫氨酸

双氯乙酸

氧化磷酸化、光合磷酸化扰乱剂

喹诺酮

放线菌素

利福平

氟尿嘧啶

LaCategoríaFisiológica

硫胺焦磷酸素

此物是维生素

(又叫硫胺素,

抗脚气病维生素

等等)的衍生物。说到维生素,曾经被我们用来做安息香缩合(两

分子苯缩合为羟基苯乙酮)的催化剂。想想机理就知道上的

噻唑酸性对亲核进攻羰基起了大作用。关于杂环氢原子酸性

的亲核进攻在酶催化机理上的重要作用,还可参见罗老师生化部分

的(糜蛋白酶)中的那两个重要的,此

处不再废话。

在生化反应中的作用类似,在醛酮等羰基化合物的生成和裂解反

应中发挥作用。在哪些酶中出现过?

(酸脱氢酶)——见

α(α戊二酸脱氢酶)——见

前两个酶都可以归纳为α酮酸脱氢酶,典型特征为氧化脱羧,产物为

活化了的酰基化合物。

(酸脱羧酶)——见发酵。这个反应

比较不同一点,因为这并不是氧化脱羧,而只是一次很普通的脱羧,

但的确,产物乙醛是羰基化合物。

生物素

且看生物素的结构:

生物素在生化书中常被描

述为一碳单位载体,也就

是通常体现为的载体,

显然它就在各种羧化酶

中扮演极其重要的角色了。来看看吧。

(丙酸羧化酶)——对于这个比较复杂的

酶,千万不要说没见过它。其于线粒体中,负责把酸转化为

草酰乙酸,这么一来呢:

,作为的补充反应,维持草酰乙酸的正常

供应;

,在糖异生途径中,作为生成途中的一步反应

(顺便提醒诸位,草酰乙酸是不能透过线粒体膜的!);

,在肥酸合成途径中,作为从线粒体到胞液的柠檬

酸系统的一员,忠实执行的第一步合成柠檬酸——不过这个时候

柠檬酸合成出来就被运出去啦。

乙酰辅酶羧化酶——见肥酸合成途径。这

位负责合成丙二酰辅酶。

丙酰辅酶羧化酶——见肥酸合成途径。

乍一看还真没见过,不过它的确出现了,在奇数碳肥酸的氧化过程中,这

个酶(但参与的酶不只它一个)帮助了丙酰辅酶转化为琥珀酰辅

酶。

丙二酰辅酶

既然提到了它,就顺便说说。但这货绝对不简单。

,琥珀酸(酸)脱氢酶(

)的抑制剂,可以理解成为避免能量浪费而有

此策;

,肉碱酰基转移酶(位

置粒体外膜上,注意还有转移酶,粒体内

膜内

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