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基因数据解读师考试试卷
一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)
以下哪个数据库主要用于存储单核苷酸变异(SNV)和小插入缺失的原始位点信息?
A.dbSNP
B.ClinVar
C.gnomAD
D.HGMD
答案:A
解析:dbSNP(数据库SNP)是NCBI维护的全球最大的遗传变异原始位点数据库,主要存储SNV、插入缺失等变异的位置和频率信息;ClinVar侧重变异的临床意义注释(致病性/良性);gnomAD是群体变异频率数据库;HGMD(人类基因突变数据库)专注致病突变。
根据ACMG(美国医学遗传学与基因组学学会)变异分类标准,“在多个大样本对照中未检测到该变异”属于哪类证据?
A.强致病证据(PS)
B.中等致病证据(PM)
C.强良性证据(BS)
D.支持良性证据(BP)
答案:C
解析:ACMG中BS1(强良性证据)的定义是“在大规模人群数据库中该变异频率显著高于疾病预期发病率”;BS2为“在多个大样本对照中未检测到该变异”。PS/PM为致病证据,BP为支持良性但强度弱于BS。
全外显子测序(WES)与全基因组测序(WGS)的主要区别在于?
A.WES仅覆盖编码区,WGS覆盖全基因组
B.WES数据量更大
C.WGS对重复序列的覆盖更好
D.WES更适用于结构变异检测
答案:A
解析:WES通过捕获探针富集外显子区域(约1-2%基因组),聚焦编码基因;WGS覆盖全部基因组(包括非编码区)。WES数据量小于WGS;WGS对重复序列的覆盖受限于测序技术;结构变异检测更依赖WGS或长读长测序。
连锁不平衡(LD)值r2越接近1,说明?
A.两个位点独立遗传的概率越高
B.两个位点在染色体上的物理距离越远
C.两个位点的等位基因关联越紧密
D.两个位点的突变频率差异越大
答案:C
解析:LD值r2反映两个位点等位基因的关联程度,r2=1表示完全连锁(一个位点的等位基因可完全预测另一个),r2=0表示完全独立。物理距离越近的位点通常LD越强。
常染色体隐性遗传病家系中,父母表型正常时,子女患病概率为?
A.25%
B.50%
C.75%
D.100%
答案:A
解析:父母为携带者(杂合子Aa×Aa),子女基因型概率为AA(25%)、Aa(50%)、aa(25%),仅aa表现为患者,故概率25%。
以下哪个工具主要用于基因变异的功能注释?
A.GATK
B.BWA
C.VEP(VariantEffectPredictor)
D.Samtools
答案:C
解析:VEP是EMBL开发的变异功能注释工具,可预测变异对基因/蛋白的影响(如错义突变、剪接位点改变);GATK用于变异检测,BWA用于序列比对,Samtools用于SAM/BAM文件操作。
基于NGS的拷贝数变异(CNV)检测主要依赖?
A.测序读长的断裂点
B.目标区域的覆盖深度
C.染色质构象捕获(3C)
D.单核苷酸多态性(SNP)分型
答案:B
解析:NGS检测CNV的核心原理是:若某区域发生重复(CNV增益),则测序覆盖深度会升高;若发生缺失(CNV丢失),覆盖深度会降低。断裂点分析主要用于易位/倒位等结构变异。
HLA分型的关键是准确识别以下哪个区域的变异?
A.启动子区
B.外显子2-3(抗原结合区)
C.内含子区
D.3’非翻译区
答案:B
解析:HLA(人类白细胞抗原)基因的高度多态性主要集中在外显子2和3,编码抗原结合区,直接影响免疫识别。分型需准确解析这些区域的变异。
表观遗传数据解读中,5-甲基胞嘧啶(5mC)主要影响?
A.DNA复制的准确性
B.基因的转录活性
C.蛋白质的翻译效率
D.染色体的分离过程
答案:B
解析:DNA甲基化(如5mC)通常发生在CpG岛,与基因沉默相关(如肿瘤抑制基因启动子区高甲基化会抑制转录),是表观遗传调控基因表达的主要机制。
gnomAD数据库的主要用途是?
A.存储肿瘤体细胞突变
B.提供多人群变异频率参考
C.注释药物反应相关基因
D.预测蛋白质三维结构
答案:B
解析:gnomAD(基因组聚集数据库)整合了全球14万人的基因组/外显子数据,提供各变异在不同人群中的频率(如等位基因频率AF),用于判断变异是否为“罕见”(AF0.01)。
二、多项选择题(共10题,每题2分,共20分)
ACMG变异分类标准中的致病证据包括?
A.PS(强致病证据)
B.PM(中等致病证据)
C.PP(支持致病证据)
D.BS(强良性证据)
答案:ABC
解析:ACMG将证据分为致病(PS/PM/PP)和良性(BS/BP)两大类。BS属于良性证据,故排除D。
NGS数据质控的关键指标包括?
A.Q30(测序碱基质量≥30的比例)
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