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短序列比对与组装及软件并行优化研究

在当今生命科学与信息科学交叉融合的浪潮中，短序列比对与组装技术作为基因组学研究的核心环节，其效率与准确性直接决定了下游分析的质量。随着高通量测序技术的飞速发展，海量短序列数据以前所未有的速度产生，传统的序列处理方法在面对PB级数据时愈发力不从心，因此，对短序列比对与组装及相关软件的并行优化研究成为了亟待攻克的前沿课题。

短序列比对旨在将测序得到的短序列精准定位到参考基因组的相应位置，这一过程如同在浩瀚的基因海洋中为每一段短序列找到“归宿”。然而，短序列长度较短、易受测序错误干扰以及基因组中存在重复序列等问题，使得比对工作极具挑战性。现有的比对算法，如