全基因组关联分析定位水稻垩白QTL及候选基因分析.pdfVIP

江西农业大学学报2025，47（5）http://xuebao.jxau.

ActaAgriculturaeUniversitatisJiangxiensis/10.3724/aauj.2025105

刘旭，陈亮，李先圣，等.全基因组关联分析定位水稻垩白QTL及候选基因分析［J］.江西农业大学学报，2025，47（5）：1224-

1234.

LIUX,CHENL,LIXS,etal.Genome-wideassociationstudyformappingQTLsandcandidategeneanalysisofricechalkiness[J].

ActaagriculturaeuniversitatisJiangxiensis,2025,47(5):1224-1234.

江西农业大学百廿华诞专刊特约稿

全基因组关联分析定位水稻垩白QTL

及候选基因分析

1，21，21，21，21，21，2

刘旭，陈亮，李先圣，钟奇，MvuyeniNyasulu，朱晓霞，

1，21，21，21，21，2*

杨家健，丁晗，杨玉萍，贺浩华，边建民

（1.江西农业大学教育部多熟制作物遗传改良国际合作联合实验室，江西南昌330045；2.江西农业大学教育部作

物生理生态与遗传育种重点实验室，江西南昌330045）

摘要：【目的】水稻垩白是影响稻米商品价值的关键指标之一。虽然水稻籽粒垩白数量性状位点（QTL）和基因的

鉴定研究取得了一定进展，但仍不能完全满足水稻育种需求。因此，从水稻种质资源中挖掘更多与垩白相关的

QTL和基因，对于推动优质水稻新品种选育工作具有重要意义。【方法】利用144份具有代表性的水稻品种作为

试验材料。2023年分别在南昌和高安实验基地种植，在成熟期收获后进行水稻垩白粒率和垩白度测定，结合基

因型通过GEMMA软件进行全基因组关联分析。【结果】在南昌环境下，定位到16个与垩白相关的QTLs，其中12个

与垩白粒率相关，4个与垩白度相关；在高安环境下，定位到3个与垩白相关的QTLs，其中1个与垩白粒率相关，

2个与垩白度相关。结果表明，10号染色体上的qPGWCNC10-2、qPGWCGA10-2、qDECNC-10和qDECGA-10定

位于同一个区间。对10号染色体上的QTLs进行分析，筛选出3个与籽粒垩白相关的候选基因，分别为

LOC_Os10g14870、LOC_Os10g17690和LOC_Os10g17930。【结论】本研究挖掘到新的水稻垩白相关位点并对候选

基因进行了分析，为垩白新QTL（基因）的克隆以及垩白的遗传改良提供参考。

关键词：水稻；GWAS；垩白粒率；垩白度；QTL；候选基因

中图分类号：S511文献标志码：A开放科学（资源服务）标识码（OSID）：

文章编号：1000-2286（2025）05-1224-11

CSTR：32399.14.aauj.2025105

Genome-wideassociationstudyformappingQTLsand

candidategeneanalysisofricechalkiness

LIUXu1,2，CHENLiang1,2，LIXiansheng1,2，ZHONGQi1,2，MvuyeniNyasulu1,2，

ZHUXiaoxia1,2，YANGJiajian1,2，DINGHan1,2，YANGYupi