高分子链经纳米孔移位的动力学模拟.pdfVIP

高分子链经纳米孔移位的动力学模拟.pdf

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致谢

时光如白驹过隙,三年的求是园学习生涯也一晃而过,转眼间充实而美好的研究生生

活即将画上句号。在这三年的科研学习过程中,我得到了老师、同学以及朋友们的帮助,

关心和关怀。此时我心中有万般的不舍与感慨,借此之际,我要向在这期间给与我支持,

关爱和鼓励的人表达我最诚挚的谢意。

首先我要衷心地感谢我的导师罗孟波教授。罗老师是我学习和科研工作的引路人,罗

老师知识渊博、学术水平高超、科研与治学态度严谨,每当我科研或者学习遇到困难时,

罗老师总能迅速地找到问题所在,耐心解答,循循善诱地指导我直到完全解决问题,每次

与罗老师讨论都如沐春风一般。罗老师还让我从一个科研小白逐渐明白了科研的内涵,一

步步指导我如何思考科研中遇到的问题、也教会了我如何写论文,罗老师对待科研严谨认

真的态度让我受益匪浅。罗老师也是我生活中的掌灯者,在生活中不论遇到任何困难罗老

师都会帮忙解决,罗老师会经常关心我的生活情况,我遇到挫折罗老师也会不断的鼓励我,

在找工作的过程中也给了我很多关心和建议。在这里我还要感谢我的师母黄建花教授,黄

老师对我们无微不至的关心让我们倍感亲切。

感谢课题组的每一位成员,特别感谢陈佳师姐和已经毕业的杨肖师姐对我的指导和帮

助;感谢已经毕业的张爽师兄、王超师兄、孙李真师兄、杨清慧师姐、冯梅师姐、田冉冉

师姐、吴凡师姐、傅愉师兄对我的关心和帮助;还要感谢我们课题组的Azhar、华道阳、

齐航凯师弟、胡涵显师妹、沈一凡师弟与你们一起吃饭和讨论的时光令人难忘。

感谢教十二429的卓博洋陪我一起去食堂吃饭、半夜一起回宿舍、我们走在路上讨论

的情形还历历在目,也感谢429的井立威学长对我学习和生活的关心。感谢在教十二312

的日子里陪我讨论交流的王乾龙、王帅、周小舟、张墨馨、林诗妍、韩斌铭、罗艺、叶芮、

宋伊,有你们的日子科研学习生活也轻松欢快了很多。同时也感谢欧新文学长、邹奥东学

长、王振华学长平日里的交流与帮助。感谢与我一起生活过的室友,金立孚、王正来、蔡

浩航、王钉,感谢你们的陪伴。

最后我要感谢我的家人,你们是我最温暖的港湾、是我最坚实的后盾,感谢你们一直

以来给予的最无私的爱,无条件地包容我、支持我、鼓励我。

陈显

2021年4月求是园

摘要

高分子链纳米孔移位的过程是生物体内一个基本却非常重要的过程,也是生物系统中

常见的现象,比如RNA从核孔中的穿出、病毒将它的DNA注入宿主细胞内、以及蛋白质

的跨膜输运等。高分子链的移位过程在生物,生命科学、物理、化学等学科领域还有着广

泛的应用前景和研究价值,比如基因检测、基因治疗、药物传递等。控制DNA的移位速

度可以提高利用纳米孔检测DNA的精度和准确率,是研究高分子链移位的一个重要内容。

本论文从控制高分子链的移位速度出发用两种模拟方法分别研究了高分子链在恒定拉力/

恒定速度作用下高分子链的移位过程以及影响DNA移位速度的因素。论文的两部分成果

如下:

(1)高分子链一端受拉力作用下穿过纳米孔移位的过程。我们使用朗之万动力学的

方法模拟了呈液滴状的高分子链在头链节受拉力作用穿过纳米孔移位的过程。由于高分子

链的链节之间存在相互吸引作用,所以高分子链在拉动前呈紧缩液滴状的状态。驱动过程

分为高分子一端受恒定拉力F和恒定速度v穿孔两种情况。我们研究了高分子链的移位时

间τ与拉力F的标度关系,高分子链的移位时间τ与链长N和驱动速度ν的标度关系。在

高分子链的链内相互作用较小或者拉力也较大时,高分子链的移位时间τ与拉力F的标度

关系是τF−,其中标度指数是δ=0.88。我们发现在外力足够大时,标度指数δ几乎和

链长无关而只与链内相互作用有关。在高分子链的链长N较小或吸引作用较弱时,移位时

间与链长的标度关系是τNα,其中标度指数α1.6,并且移位时间与链内相互作用强度

无关。当链长足够大时受链内相互作用的影响,不同的相互作用导致不同的移位指数α。

当驱动速度较大或者链内相互作用较大时,我们得到了移位时间τ和驱动速度ν的关系是

τv-

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