广西壮族自治区猪圆环病毒2型(PCV2)分子流行病学调查及遗传变异分析.pdfVIP

畜牧与饲料科学AnimalHusbandryandFeedScience2024,45(2):109-115

黄美芝，何奇松，冯淑萍，等.广西壮族自治区猪圆环病毒2型（PCV2)分子流行病学调查及遗传变异分析[J].畜牧与饲料科学，

2024,45(2):109-115.

D01I:10.12160/j.issn.1672-5190.2024.02.014

广西壮族自治区猪圆环病毒2型(PCV2)

分子流行病学调查及遗传变异分析

黄美芝1,何奇松²,冯淑萍²,龙凤²,尹彦文²,莫胜兰²2胡丽萍2,

黄胜斌²,韩银华²,周庆安²,蓝惠华²,韦海娜2,魏园园²,甘雨²,施开创？

（1.广西壮族自治区南宁市隆安县动物疫病预防控制中心，广西隆安532700;2.广西壮族自治区动物疫病预防控制中

心,广西南宁530001)

摘要：［目的］了解猪圆环病毒2型(porcinecircovirustype2,PCV2)在广西壮族自治区的流行情况及遗

传特征。［方法]采用PCR方法对广西壮族自治区不同地区送检的病料进行PCV2检测和全基因组序

列扩增。应用BioEdit、Mega7.0、RDP5和SimPlot(ver3.5.1)软件对获得的24株PCV2毒株全基因组序

列进行核苷酸序列相似性、遗传变异和重组分析,并对Cap蛋白氨基酸序列变异位点进行分析。［结

果JPCV2广西株基因组大小均为1768bp;核苷酸序列相似性分析显示，广西株与参考株PCV1~PCV4

的相似性在44.7%~99.7%，与PCV3亲缘性最低；广西株为PCV2b和PCV2d型，PCV2d流行最为广

泛；全基因组序列重组分析显示，部分广西株存在重组事件；与疫苗株AY686764-PCV2b和

HM641752-PCV2b相比,PCV2广西株的Cap蛋白氨基酸序列共有21个位点发生变异。［结论]PCV2

广西流行毒株以PCV2d型为主，部分毒株具有重组现象，部分位点发生独特的氨基酸变异，遗传进化

趋势明显。研究结果为广西壮族自治区PCV2的流行病学调查和遗传进化特征分析提供了基本数据。

关键词：猪圆环病毒2型；全基因组；相似性；遗传变异

中图分类号：S852.659.2文献标志码：A文章顺序编号：1672-5190(2024)02-0109-07

MolecularEpidemiologicalInvestigationandGeneticVariationAnalysisofPorcine

CircovirusType2(PCV2)inGuangxiZhuangAutonomousRegion

HUANGMeizhi,HEQisong,FENGShuping,LONGFeng,YINYanwen,MOShenglan,HULiping,

HUANGShengbin²,HANYinhua,ZHOUQingan’,LANHuihua²,WEIHaina’,WEIYuanyuan?,GANYu?,

SHIKaichuang

(1.AnimalDiseasePreventionandControlCenterofLonganCountyofNanningCityofGuangxiZhuangAutonomousRegion,

Longan532700,China;2.AnimalDiseasePreventionandControlCenterofGuangxiZhuangAutonomousRegion,Nanning

530001,China)

Abstract:[Objective]Thisstudywasconductedtounderstandthepre