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图神经网络异构加速系统中CPU-GPU协同通信协议及高效内存一致性管理方法1

图神经网络异构加速系统中CPU-GPU协同通信协议及高

效内存一致性管理方法

1.图神经网络加速系统概述

1.1图神经网络基本原理

图神经网络（GraphNeuralNetworks，GNNs）是一种强大的深度学习模型，用于

处理图结构数据。其基本原理是通过聚合节点的邻域信息来更新节点的特征表示，从而

实现对图结构数据的特征学习和分析。

•图的表示：图由节点（vertices）和边（edges）组成，节点表示数据实体，边表示

节点之间的关系。图可以分为同构图和异构图。同构图中所有节点和边的类型相

同，而异构图中节点和边可以有不同的类型，这增加了图的复杂性，但也更贴近

现实世界的数据结构。

•消息传递机制：GNNs的核心是消息传递机制。每个节点会聚合其邻域节点的信

息，并通过聚合后的信息更新自身的特征表示。这一过程可以表示为

(l+1)∑(l)



hv=σevuhu

u∈N(v)

，其中h(l)是节点v在第l层的特征表示，N(v)是节点v的邻域节点集合，evu

v

是节点u到节点v的边的权重，σ是激活函数。

•应用场景：GNNs在许多领域都有广泛的应用，例如社交网络分析、生物信息学、

推荐系统等。在社交网络中，GNNs可以用于用户关系预测和社区检测；在生物

信息学中，GNNs可以用于蛋白质相互作用网络的分析；在推荐系统中，GNNs可

以用于用户和物品的匹配。

1.2异构加速系统架构

异构加速系统是指利用多种不同类型的计算设备（如CPU、GPU、FPGA等）协

同工作，以提高计算效率和性能。在图神经网络加速系统中，CPU和GPU的协同通信

协议及高效内存一致性管理方法是关键。

•CPU和GPU的特点：CPU具有强大的通用计算能力和复杂的控制逻辑，适合

处理复杂的任务调度和数据管理；GPU具有大量的并行计算单元，适合处理大规

模并行计算任务，如矩阵运算和图神经网络的节点更新。因此，将CPU和GPU

结合起来，可以充分发挥它们的优势，提高图神经网络的加速效果。

2.CPU-GPU协同通信协议2

•协同通信协议：在异构加速系统中，CPU和GPU之间的通信效率至关重要。常

见的通信协议包括PCIe总线通信和InfiniBand高速网络通信。PCIe总线通信可

以直接连接CPU和GPU，实现高速数据传输，但其带宽有限；InfiniBand高速

网络通信可以提供更高的带宽和更低的延迟，适合大规模分布式计算环境。为了

提高通信效率，需要设计高效的通信协议，减少通信开销和延迟。

•内存一致性管理：在异构系统中，CPU和GPU各自有自己的内存空间，如何保

持内存数据的一致性是一个关键问题。一种常见的方法是使用统一内存（Unified

Memory），它允许CPU和GPU共享同一块内存空间，从而简化内存管理。另一

种方法是通过软件机制实现内存一致性，例如使用缓存一致性协议和数据同步机

制，确保CPU和GPU访问到的数据是最新的。

•系统架构设计：一个典型的图神经网络异构加速系统架构包括CPU、GPU、内存、

存储设备和通信网络。CPU负责任务调度、数据管理和复杂的控制逻辑；GPU

负责执行图神经网络的并行计算任务；内存用于存储节点特征、邻接矩阵等数据；

存储设备用于存储大规模图数据；通信网络用于实现CPU