探秘HIV-1 B’亚型毒株：全基因组分子克隆解析与洞察.docxVIP

探秘HIV-1B’亚型毒株：全基因组分子克隆解析与洞察

一、绪论

1.1研究背景

自1981年人类首次发现艾滋病（AIDS）以来，艾滋病的蔓延对全球公共卫生构成了严重威胁。艾滋病是由人类免疫缺陷病毒（HIV）感染引起的一种危害性极大的传染病，该病毒主要攻击人体免疫系统中的CD4+T淋巴细胞，导致人体免疫功能严重受损，从而引发各种机会性感染和恶性肿瘤，最终危及生命。

据全球健康指标与评估研究所（IHME）和华盛顿大学共同完成的研究论文显示，2010年，全球每年新增HIV感染病例为211万例，到2021年这一数字下降至165万例，降幅为22%，HIV相关死亡人数从2010年的119万例减少至2021年的71.8万例，下降了39.7%。尽管全球在HIV防控方面取得了一定进展，但截至2021年，全球HIV感染者总人数（PWH）已达到4000万，较2010年的2900万有大幅增加，且研究预测这一趋势将持续，到2039年，全球HIV感染者人数将达到峰值4440万，随后逐步下降。

目前，虽然抗逆转录病毒治疗（ART）已显著改善了HIV感染者的生活质量和预期寿命，但由于HIV具有高度变异性，其遗传多样性给艾滋病的防治工作带来了诸多挑战，包括疫苗研发、诊断试剂的敏感性和特异性、药物耐药性监测等方面。因此，深入研究HIV的分子生物学特性和遗传多样性，对于揭示病毒的传播规律、开发有效的防治策略以及推动艾滋病疫苗的研发具有至关重要的意义。

1.2HIV概述

HIV是一种逆转录病毒，其病毒颗粒呈球形，直径约为100-120nm，典型的HIV-1颗粒由核心和包膜两部分组成。病毒外膜是脂蛋白的包膜，来自宿主细胞，嵌有病毒的糖蛋白gp120和gp41，其中gp120是病毒表面抗原，为外膜糖蛋白，gp41是跨膜糖蛋白，二者通过非共价作用结合。病毒核心为锥形，由蛋白p24组成的半锥形衣壳包裹，内含病毒RNA基因组、核心结构蛋白和病毒复制所必须的酶类，如逆转录酶、整合酶、蛋白酶等。HIV的RNA为两条相同的正股RNA链，构成了其独特的基因组结构。

HIV-1基因组长度约9.2KB，基因高度变异。从5端到3端依次为5LTR-gag-pol-env-3LTR，5端有帽状结构m7G5ppp5GmpNp，3端有polyA序列。除三个编码结构蛋白的基因gag、pol、env外，HIV还有多个调节基因和附加基因，目前已发现至少有7种，分别是tat、rev、nef、vpr、vpu、vpx（仅存在于HIV-2中）和vif。这些基因编码的蛋白质在病毒的整个感染及复制过程中具有非常重要的作用：

LTR（长末端重复序列）：不编码病毒产物，但对于病毒基因表达的起始和调节至关重要，其上有许多细胞转录因子的结合位点，可分为调节单位、核心转录单位和反式激活效应元件单位（TAR）三个不同的调控功能区。

Gag基因：编码约500个氨基酸组成的聚合前体蛋白，经蛋白酶水解形成P17，P24核蛋白等，使RNA不受外界核酸酶破坏，这些蛋白参与构成HIV颗粒的内壳和内膜等结构。

Pol基因：编码聚合酶前体蛋白，经切割形成蛋白酶、整合酶、逆转录酶、核糖核酸酶H，均为病毒增殖所必需的酶类，在病毒复制过程中发挥关键作用。

Env基因：编码约863个氨基酸的前体蛋白并糖基化成gp160，进一步被切割为gp120和gp41。gp120含有中和抗原决定簇，其V3环区在病毒与细胞融合中起重要作用，且能与细胞的CD4受体蛋白相结合；gp41与靶细胞融合，促使病毒进入细胞内。

Tat基因：编码蛋白可与LTR结合，增加病毒所有基因转录率，也能在转录后促进病毒mRNA的翻译。

Rev基因：产物是一种顺式激活因子，能对env和gag中顺式作用抑制序去抑制作用，增强gag和env基因的表达，以合成相应的病毒结构蛋白。

Nef基因：编码蛋白P27对HIV基因的表达有负调控作用，以推迟病毒复制，该蛋白作用于HIvcDNA的LTR，抑制整合的病毒转录，可能是HIV在体内维持持续感染所必需。

Vif基因：对HIV并非必不可少，但可能影响游离HIV感染性、病毒体的产生和体内传播。

Vpu基因：为HIV-1所特有，对HIV的有效复制及病毒体的装配与成熟不可少，促进HIV-1从细胞膜上释放。

Vpr基因：编码蛋白是一种弱的转录激活物，在体内繁殖周期中起一定作用，能使HIV在巨噬细胞中增殖。

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