面向分层异构处理器的图神经网络计算图编译器优化策略研究.pdfVIP

面向分层异构处理器的图神经网络计算图编译器优化策略研究1

面向分层异构处理器的图神经网络计算图编译器优化策略研

究

1.研究背景

1.1图神经网络概述

图神经网络（GraphNeuralNetworks,GNNs）是一种强大的深度学习模型，用于专

门处理图结构数据。图结构数据广泛存在于许多领域，如社交网络、生物信息学、推荐

系统等。GNNs通过聚合节点的邻域信息来更新节点的特征表示，从而能够捕捉图中的

复杂关系和结构信息。例如，在社交网络中，GNNs可以用于预测用户之间的关系、推

荐朋友等任务；在生物信息学中，GNNs可以用于蛋白质相互作用网络的分析和药物发

现。近年来，GNNs在各种任务上都取得了显著的性能提升，如节点分类、图分类、链

接预测等。然而，GNNs的计算复杂度较高，尤其是在大规模图数据上，其计算效率和

资源消耗成为了一个关键问题。

1.2分层异构处理器特点

分层异构处理器是一种由多种不同类型的计算单元组成的计算架构，旨在通过充

分利用不同计算单元的优势来提高计算效率和性能。分层异构处理器通常包括CPU、

GPU、FPGA、ASIC等，每种计算单元都有其独特的特点和适用场景。例如，CPU具

有强大的通用计算能力和灵活的控制能力，适合处理复杂的控制逻辑和小规模的计算

任务；GPU具有高度并行的计算能力，适合处理大规模的并行计算任务，如矩阵运算

和深度学习模型的训练和推理；FPGA具有可重构性和低延迟的特点，适合处理实时性

和确定性要求较高的计算任务；ASIC则是一种为特定应用定制的芯片，具有最高的性

能和能效比，但缺乏灵活性。分层异构处理器通过将不同的计算任务分配到最适合的计

算单元上，可以实现计算资源的优化配置，提高系统的整体性能和能效。

2.计算图编译器基础

2.1编译器工作原理

计算图编译器是优化图神经网络（GNNs）在分层异构处理器上运行效率的关键工

具。其工作原理主要包括以下几个阶段：

•前端解析：编译器首先解析GNN模型的高级描述，将其转换为中间表示（IR）。

例如，对于一个典型的GNN模型，如GraphSAGE，编器译会将其节点聚合和更

2.计算图编译器基础2

新操作解析为一系列的算子，如矩阵乘法、向量加法等。这些算子在IR中以计算

图的形式表示，每个节点代表一个算子，边代表数据依赖关系。

•中间表示优化：在IR阶段，编译器会对计算图进行一系列的优化操作。例如，通

过算子融合技术，将多个连续的算子合并为一个，减少内存访问次数和计算开销。

以一个包含多个逐元素操作的计算序列为例，编译器可以将这些操作融合为一个

复合操作，从而提高计算效率。此外，编译器还会进行常量传播、死代码消除等

优化，进一步提升性能。

•后端代码生成：根据目标分层异构处理器的架构特点，编译器将优化后的IR转

换为目标机器代码。对于不同的计算单元，如CPU、GPU等，编译器会生成相应

的指令集。例如，在GPU上，编译器会利用其并行计算能力，生成高效的CUDA

代码，将计算任务分配到多个线程上并行执行。对于FPGA，编译器会生成硬件

描述语言（HDL）代码，根据FPGA的可重构性特点，定制化地实现计算任务，

以满足低延迟和高吞吐量的要求。

2.2计算图优化技术

为了提高GNNs在分层异构处理器上的运行效率，计算图编译器采用了多种优化

技术：

•算子融合：通过将多个相邻的算子合并为一个，减少内存访问次数和计算开销。例

如，在一个包含多个逐元素操作的计算序列中，编译器可以将这些操作融合为一

个复合操作，从而提高计算效率。研究表明，在某些GNN模型中，算子融合可

以将内存访问次数减少30%以上，显著提升性能。

•内存优化：针对GNNs中大量的稀疏矩阵操作，编译器采用了稀疏矩阵压缩存储

格式，如CSR（Compressed