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单细胞聚类标记基因试题库及答案
一、单项选择题(每题2分,共10题)
1.以下哪种方法常用于单细胞聚类分析?
A.PCR
B.层次聚类
C.Westernblot
答案:B
2.单细胞聚类的主要目的是?
A.寻找细胞共性
B.检测基因突变
C.培养细胞
答案:A
3.标记基因的作用是?
A.确定细胞类型
B.调控细胞周期
C.参与代谢反应
答案:A
4.以下哪种技术可用于单细胞标记基因检测?
A.流式细胞术
B.质谱分析
C.凝胶电泳
答案:A
5.单细胞聚类时首先要进行的步骤是?
A.数据预处理
B.选择聚类算法
C.确定标记基因
答案:A
6.聚类结果中每个簇代表?
A.相同基因表达的细胞
B.不同大小的细胞
C.不同来源的细胞
答案:A
7.用于标记神经元细胞的常见基因是?
A.CD4
B.MAP2
C.GFP
答案:B
8.单细胞转录组测序可用于?
A.寻找标记基因
B.分析蛋白质结构
C.构建基因文库
答案:A
9.聚类分析中距离度量方法不包括?
A.欧氏距离
B.马氏距离
C.基因距离
答案:C
10.以下哪个不是单细胞聚类标记基因筛选的标准?
A.高表达量
B.细胞特异性
C.基因长度
答案:C
二、多项选择题(每题2分,共10题)
1.单细胞聚类分析常用算法有()
A.K-means聚类
B.密度聚类
C.谱聚类
答案:ABC
2.标记基因筛选方法包括()
A.差异表达分析
B.富集分析
C.基因编辑
答案:AB
3.单细胞测序技术能检测()
A.基因表达水平
B.基因拷贝数变异
C.染色质可及性
答案:ABC
4.影响单细胞聚类结果的因素有()
A.数据质量
B.聚类参数选择
C.样本来源
答案:ABC
5.用于鉴定免疫细胞类型的标记基因有()
A.CD3
B.CD19
C.CD8
答案:ABC
6.单细胞聚类分析在哪些领域有应用()
A.肿瘤研究
B.神经科学
C.发育生物学
答案:ABC
7.以下属于单细胞数据预处理步骤的有()
A.归一化
B.过滤低质量细胞
C.降维
答案:ABC
8.选择标记基因的原则有()
A.特异性表达
B.高表达稳定性
C.与细胞功能相关
答案:ABC
9.聚类结果评估指标有()
A.轮廓系数
B.兰德指数
C.均方误差
答案:AB
10.单细胞聚类分析的意义在于()
A.发现新细胞类型
B.了解细胞分化轨迹
C.解析细胞间相互作用
答案:ABC
三、判断题(每题2分,共10题)
1.单细胞聚类只能用一种算法。(×)
2.所有基因都可以作为标记基因。(×)
3.单细胞测序能直接确定细胞功能。(×)
4.聚类结果的好坏只取决于算法。(×)
5.标记基因在所有细胞类型中表达相同。(×)
6.数据预处理对单细胞聚类结果影响不大。(×)
7.不同物种的细胞聚类方法完全不同。(×)
8.层次聚类不需要指定聚类数量。(√)
9.筛选标记基因不需要生物学验证。(×)
10.单细胞聚类分析不能用于疾病诊断研究。(×)
四、简答题(每题5分,共4题)
1.简述单细胞聚类分析的基本流程。
答:首先进行单细胞数据获取,接着数据预处理,包括归一化、过滤低质量细胞等;再选择合适聚类算法进行聚类;最后对聚类结果评估和解读,筛选标记基因确定细胞类型。
2.为什么要筛选单细胞聚类标记基因?
答:标记基因能明确区分不同细胞类型,有助于发现新细胞亚群;可用于验证聚类结果准确性;还能深入了解细胞功能和分化轨迹,为生物学研究提供关键信息。
3.单细胞转录组测序在标记基因研究中的作用是什么?
答:可全面测量单细胞基因表达水平,发现细胞间基因表达差异,通过分析这些差异筛选出特定细胞类型的标记基因,为细胞分类和功能研究提供依据。
4.简述K-means聚类算法在单细胞聚类中的原理。
答:先随机选择K个初始聚类中心,计算每个细胞到各中心的距离,将细胞分配到最近中心所在簇;然后重新计算各簇中心,重复此过程,直到聚类中心不再变化或满足停止条件。
五、讨论题(每题5分,共4题)
1.讨论如何提高单细胞聚类标记基因筛选的准确性。
答:可采用多种筛选方法结合,如差异表达与富集分析;增加样本量和多样性;严格数据预处理,去除噪声;进行生物学验证,如基因敲除、免疫组化,以确保标记基因的特异性和准确性。
2.分析单细胞聚类标记基因研究在肿瘤治疗中的潜在应用。
答:能发现肿瘤细胞亚群及对应标记基因,有助于肿瘤精准分型;了解肿瘤细胞分化轨迹,明确
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