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低覆盖度测序填补方法试题库及答案
一、单项选择题(每题2分,共10题)
1.低覆盖度测序数据中,哪种碱基的错误率可能较高?
A.AB.TC.CD.G
答案:A
2.以下常用于低覆盖度测序填补的算法是?
A.BLASTB.SOAPC.IMPUTED.ClustalW
答案:C
3.低覆盖度测序填补的主要目的是?
A.提高测序深度B.校正测序错误
C.获得完整基因组D.降低测序成本
答案:C
4.低覆盖度测序中,导致数据缺失的原因不包括?
A.测序技术局限B.样本量过大
C.基因组结构复杂D.测序仪器故障
答案:B
5.哪种数据格式常用于存储低覆盖度测序数据?
A.DOCXB.PDFC.FASTQD.XLSX
答案:C
6.低覆盖度测序填补方法通常利用的信息是?
A.已知基因组参考序列B.蛋白质结构信息
C.代谢产物信息D.细胞形态信息
答案:A
7.低覆盖度测序填补对哪种研究影响较大?
A.细胞形态观察B.基因功能验证
C.物种进化分析D.药物化学合成
答案:C
8.以下哪种不是低覆盖度测序填补面临的挑战?
A.数据准确性B.计算资源需求
C.样本采集困难D.算法复杂性
答案:C
9.低覆盖度测序数据质量评估指标不包括?
A.碱基质量值B.测序深度分布
C.基因表达量D.错误率
答案:C
10.常用的低覆盖度测序填补工具不包括?
A.BEAGLEB.PLINKC.RSEMD.Minimac
答案:C
二、多项选择题(每题2分,共10题)
1.低覆盖度测序填补方法的优势有()
A.降低测序成本B.提高数据分析效率
C.适用于珍稀样本D.完全消除测序错误
答案:ABC
2.影响低覆盖度测序填补效果的因素有()
A.参考基因组质量B.测序数据量
C.填补算法D.样本性别
答案:ABC
3.以下属于低覆盖度测序填补算法特点的有()
A.准确性B.高效性C.通用性D.复杂性
答案:ABCD
4.低覆盖度测序填补在哪些领域有应用()
A.农业育种B.疾病诊断C.生态研究D.材料科学
答案:ABC
5.低覆盖度测序数据预处理步骤包括()
A.质量过滤B.碱基校正C.序列比对D.基因注释
答案:ABC
6.低覆盖度测序填补可能存在的问题有()
A.填补错误B.遗漏真实变异C.计算时间长D.结果不可靠
答案:ABCD
7.选择低覆盖度测序填补工具时需考虑的因素有()
A.适用物种B.功能特点C.软件易用性D.价格
答案:ABC
8.低覆盖度测序与高覆盖度测序相比,其特点有()
A.成本低B.数据量少C.变异检测更准确D.更易获得完整基因组
答案:AB
9.低覆盖度测序填补算法的发展趋势包括()
A.更高准确性B.更低计算资源需求
C.更广泛适用性D.更复杂算法设计
答案:ABC
10.低覆盖度测序填补中利用的遗传信息有()
A.单核苷酸多态性B.基因连锁不平衡
C.拷贝数变异D.蛋白质序列
答案:ABC
三、判断题(每题2分,共10题)
1.低覆盖度测序填补可以完全替代高覆盖度测序。(×)
2.填补算法的准确性与参考基因组质量无关。(×)
3.低覆盖度测序数据质量只取决于测序仪器。(×)
4.所有低覆盖度测序填补工具都适用于任何物种。(×)
5.提高测序深度一定能提高低覆盖度测序填补效果。(×)
6.低覆盖度测序填补在疾病研究中没有应用价值。(×)
7.填补算法越复杂,填补效果一定越好。(×)
8.低覆盖度测序数据预处理对填补结果影响不大。(×)
9.低覆盖度测序填补可以发现新的基因变异。(√)
10.低覆盖度测序填补只需要考虑测序数据,不需要考虑生物学背景。(×)
四、简答题(每题5分,共4题)
1.简述低覆盖度测序填补的基本原理。
答案:利用已知的参考基因组序列,结合低覆盖度测序数据中的部分信息,通过特定算法如基于连锁不平衡等原理,推测和填补缺失的序列信息。
2.低覆盖度测序填补对参考基因组有哪些要求?
答案:要求参考基因组质量高,完整性好,注释准确。高质量参考基因组能为填补提供可靠模板,完整且准确注释有助于更好理解和利用基因组信息进行填补。
3.低覆盖度测序填补中数据质量评估的重要性。
答案:数据质量评估可了解测序数据的可靠性,如碱基质量、
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