脊尾白虾微卫星引物筛选及其群体遗传多样性的深度解析与应用探索.docxVIP

脊尾白虾微卫星引物筛选及其群体遗传多样性的深度解析与应用探索

一、引言

1.1研究背景与意义

脊尾白虾（Exopalaemoncarinicauda），又称白虾、五须虾和迎春虾等，在分类学上隶属甲壳纲（Crustacea）、十足目（Decapoda）、长臂虾科（Palaemonidae）、白虾属（Exopalaemon），是广泛分布于中国大陆沿岸及朝鲜半岛西岸浅海低盐区域的重要中小型经济虾类。因其肉质细腻、味道鲜美，深受消费者喜爱，在海鲜市场中占据重要地位，拥有较高的经济价值。据相关数据显示，全国每年脊尾白虾的养殖面积约达2万hm2，年产量约为45万t，其养殖区域集中分布在江苏、浙江、山东、福建和广东等沿海省份，已然成为海水养殖的重要品种。

随着脊尾白虾养殖业的蓬勃发展，人工育种工作也在稳步推进，像快速生长型脊尾白虾“黄育1号”和含高虾青素型脊尾白虾“科苏红1号”等新品种，已在沿海地区大规模推广养殖。而且，脊尾白虾对盐度的适应范围广泛，其养殖范围已成功拓展到半咸水甚至淡水区域。有研究明确指出，低盐环境更适宜脊尾白虾的生长，在低盐条件下，其生长速度显著快于高盐环境，并且低盐养殖虾类被视为控制暴发性病害的有效途径。为进一步拓展脊尾白虾在内陆低盐碱水域的规模化养殖，培育适应低盐碱水的品种，丰富内陆盐碱水养殖虾类的种类，对脊尾白虾的深入研究显得尤为重要。

微卫星标记，又被称作简单序列重复（SimpleSequenceRepeat，SSR）或短串联重复（ShortTandemRepeats，STR），由1-10bp核苷酸为重复单元的微卫星本体和两侧的侧翼序列构成，具有典型的高突变性，是群体遗传研究中常用的分子标记。在脊尾白虾的研究领域，筛选有效的微卫星引物是开展遗传研究的关键基础。精准筛选出的微卫星引物，能够为后续深入研究脊尾白虾的群体遗传结构、遗传多样性以及亲缘关系等提供不可或缺的工具。通过这些引物，我们可以更加准确地分析脊尾白虾的遗传信息，为其种质资源的保护和利用筑牢根基。

群体遗传多样性分析则是了解脊尾白虾种群健康状况和进化潜力的核心手段。深入剖析脊尾白虾的群体遗传多样性，不仅能够让我们清晰掌握不同地理群体或养殖群体之间的遗传差异和遗传关系，还能为制定科学合理的养殖策略、种质资源保护措施以及遗传改良方案提供坚实的数据支撑。例如，通过对不同群体遗传多样性的分析，我们可以明确哪些群体具有更丰富的遗传资源，哪些群体需要重点保护和优化，从而有针对性地开展相关工作。

本研究聚焦于脊尾白虾微卫星引物筛选及群体遗传多样性分析，旨在开发出高效、特异的微卫星引物，并全面评估脊尾白虾的群体遗传多样性，这对于脊尾白虾养殖业的可持续发展、种质资源的有效保护以及遗传改良的深入推进都具有重大的理论和实践意义。在理论层面，能够丰富我们对脊尾白虾遗传特性的认知，完善甲壳动物遗传多样性的研究体系；在实践方面，为脊尾白虾的良种选育、养殖管理以及资源保护提供切实可行的科学依据，助力脊尾白虾产业的健康、稳定发展。

1.2国内外研究现状

在脊尾白虾微卫星引物筛选方面，国内研究已取得一定成果。贾舒雯采用人工合成的生物素标记（AG）??探针及磁珠富集法，成功构建了海州湾脊尾白虾基因组微卫星富集文库。从该文库中设计的119对微卫星引物里，有64对扩增出稳定且具特异性的条带，经30个脊尾白虾个体进行多样性评价后，26个位点展现出多态性。同样运用磁珠富集法，针对莱州湾脊尾白虾构建基因组微卫星富集文库，设计的微卫星引物经30个个体评价后，有30个位点表现出多态性。这些研究为脊尾白虾微卫星引物的筛选提供了有效的方法和一定数量的可用引物。

国外对于脊尾白虾的研究相对较少，主要集中在其生物学特性和生态分布方面，在微卫星引物筛选领域的研究成果较为匮乏。

在脊尾白虾群体遗传多样性研究方面，国内诸多学者运用微卫星分子标记开展了深入研究。张晓宇等人采用微卫星分子标记，对低盐条件下脊尾白虾2021-2023年间4个连续世代GP2~GP5养殖群体的遗传多样性和遗传分化进行分析。结果显示，对11个微卫星位点扩增，共检测到70个等位基因，片段长度在138-296bp之间，10个位点呈中高度多态。研究表明，低盐养殖条件下脊尾白虾第2代到第5代遗传多样性较为丰富，处于中等水平，具备良好的选育潜力，但需注意防止有效群体大小较低的问题，避免近亲交配导致优良性状丢失。袁杭洋等人采用PCR产物纯化测序方法，测定了中国沿海7个野生群体总计210个脊尾白虾样品的COI和16SrRNA基因序列，分析得出黄海群体遗传多样性最高，南海群体遗传多样性最低，且群体内遗传变异大于群