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林木全基因组关联分析GWAS试题库及答案

一、单项选择题（每题2分，共10题）

1.GWAS主要研究的是（）

A.基因功能B.基因与性状关联C.基因表达调控D.基因突变

2.以下哪种群体适合用于GWAS（）

A.近交系群体B.自然群体C.F1群体D.BC1群体

3.GWAS分析中常用的标记是（）

A.SSRB.SNPC.RFLPD.AFLP

4.进行GWAS时，样本量一般（）

A.越大越好B.越小越好C.无所谓D.固定为100

5.下列哪个不是GWAS的优势（）

A.可研究复杂性状B.无需构建群体C.能定位所有基因D.利用自然群体

6.GWAS分析流程第一步通常是（）

A.表型测定B.基因型分型C.数据质量控制D.关联分析

7.若GWAS结果显示某SNP与性状关联，该SNP（）

A.一定是功能位点B.可能在功能基因附近C.无意义D.决定性状

8.提高GWAS功效的方法不包括（）

A.增加样本量B.提高标记密度C.降低表型测定误差D.减少标记类型

9.GWAS中用于校正多重检验的方法是（）

A.t检验B.卡方检验C.Bonferroni校正D.F检验

10.GWAS能研究的性状类型是（）

A.数量性状B.质量性状C.两者都可D.两者都不可

答案：1.B2.B3.B4.A5.C6.A7.B8.D9.C10.C

二、多项选择题（每题2分，共10题）

1.GWAS常用的软件有（）

A.PLINKB.GCTAC.TASSELD.SPSS

2.进行GWAS前，对样本要求包括（）

A.有代表性B.表型准确测定C.基因型分型准确D.样本来源单一

3.影响GWAS结果准确性的因素有（）

A.群体结构B.标记密度C.环境因素D.样本量

4.GWAS可应用于林木的（）方面研究

A.生长性状B.抗逆性C.木材品质D.开花结实

5.GWAS分析中，数据质量控制包括（）

A.去除低质量样本B.过滤低质量标记C.检查数据完整性D.对数据标准化

6.下列属于GWAS局限性的有（）

A.假阳性问题B.难以定位稀有变异C.受群体结构影响D.无法分析复杂性状

7.为减少GWAS假阳性结果，可采取的措施有（）

A.多次重复实验B.严格质量控制C.增加样本量D.选择合适分析模型

8.GWAS结果后续验证方法有（）

A.基因编辑B.遗传转化C.表达分析D.连锁分析

9.构建GWAS群体时，考虑因素有（）

A.群体遗传多样性B.群体大小C.群体亲缘关系D.群体地理分布

10.GWAS数据分析中，可能用到的统计方法有（）

A.线性回归B.逻辑回归C.方差分析D.主成分分析

答案：1.ABC2.ABC3.ABCD4.ABCD5.ABC6.ABC7.ABCD8.ABC9.ABCD10.ABCD

三、判断题（每题2分，共10题）

1.GWAS只能分析二倍体林木。（）

2.标记密度越高，GWAS定位越准确。（）

3.GWAS分析不需要知道基因的功能。（）

4.只要样本量足够，GWAS就不会出现假阳性结果。（）

5.群体结构对GWAS结果没有影响。（）

6.所有林木性状都适合用GWAS研究。（）

7.GWAS定位到的位点一定是因果位点。（）

8.进行GWAS时，基因型分型错误不影响结果。（）

9.增加标记类型可以提高GWAS效率。（）

10.GWAS结果可以直接用于林木育种。（）

答案：1.×2.√3.√4.×5.×6.×7.×8.×9.√10.×

四、简答题（每题5分，共4题）

1.简述GWAS的基本原理。

答案：利用自然群体中存在的连锁不平衡，通过对大量个体的基因型和表型数据进行统计分析，检测标记与性状之间的关联性，从而定位与性状相关的基因或位点。

2.列举GWAS数据质量控制的主要内容。