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我国部分地区猪瘟E2及HeN2F16株基因特征剖析与防控启示
一、引言
1.1研究背景与意义
猪瘟(ClassicalSwineFever,CSF)作为养猪业的重要疫病,给我国养猪业带来了巨大的经济损失。猪瘟是由猪瘟病毒(ClassicalSwineFeverVirus,CSFV)引起的一种急性、热性、高度接触性传染病,具有高发病率和高死亡率的特点。世界动物卫生组织(OIE)将其列为必须报告的动物疫病,我国也将其列为一类动物疫病。
在我国,猪瘟的流行历史悠久,对养猪业的发展造成了严重的阻碍。尽管我国自1954年成功研制出猪瘟兔化弱毒疫苗(HCLV)并广泛应用,使得猪瘟的大规模暴发和流行得到了有效控制,免疫保护率一直在90%以上。但近年来,猪瘟在全国各地仍呈零星散发性流行,且临床表现日趋复杂,出现了非典型和温和型症状,给猪瘟的防控工作带来了极大的挑战。这不仅导致患病猪只生长发育受阻,料肉比大幅上升,养殖成本显著增加,还使得猪只死亡率居高不下,严重影响了养殖收益。在疫情严重地区,大量猪只因感染猪瘟被扑杀,直接导致猪肉市场供应短缺,价格波动,进而对整个养猪产业链产生冲击。据相关统计,全球每年因猪瘟造成的经济损失高达数亿美元。
猪瘟病毒的基因变异是导致其流行和防控困难的重要原因之一。E2基因是猪瘟病毒的主要免疫原性结构基因,其编码产生的E2蛋白是诱导机体产生中和抗体的重要蛋白,对机体的免疫应答产生重要影响,与病毒的传染性密切相关,在病毒的感染能力、诱导机体免疫应答、病毒定向传向和病毒逃避免疫应答等方面都起着关键作用。而HeN2F16株作为我国部分地区出现的猪瘟病毒株,对其进行基因测定与分析,有助于深入了解猪瘟病毒在我国的流行特点和变异规律,为猪瘟的防控提供科学依据。通过研究E2及HeN2F16株的基因特征,可以明确病毒的遗传演化关系,追溯病毒的起源和传播途径,从而为制定针对性的防控策略提供有力支持。准确掌握猪瘟病毒的基因变异情况,对于疫苗的研发和应用也具有重要意义,能够确保疫苗的有效性和针对性,提高猪瘟的防控效果。
1.2国内外研究现状
国内外学者对猪瘟病毒基因进行了广泛而深入的研究。在病原学研究方面,已明确猪瘟病毒属于黄病毒科瘟病毒属,是单股正链RNA病毒,其基因组全长约12.3kb,编码的多蛋白前体经切割形成至少12种成熟病毒蛋白。
在流行病学研究中,发现猪瘟病毒在全球分布广泛,非洲、欧洲和亚洲部分国家流行严重,传播途径涵盖直接接触感染猪只、间接接触感染物质以及通过蚊子、苍蝇等媒介传播。在诊断技术上,病原学检测如病毒分离(金标准但操作复杂耗时)、RT-PCR和实时荧光定量PCR(灵敏度高、特异性好、操作简便,为临床主要手段),血清学检测如ELISA、免疫荧光抗体技术等用于检测抗体。
在疫苗研究领域,目前市面上主要有弱毒疫苗、灭活疫苗和基因工程疫苗。弱毒疫苗免疫效果好、免疫期长,却有毒力返祖风险,如部分地区曾因弱毒疫苗毒力返祖引发小规模猪瘟疫情;灭活疫苗安全性高,但免疫效果弱,需多次接种;基因工程疫苗成为研究热点,具有免疫效果好、安全性高的优势。
对于猪瘟病毒E2基因的研究,国内外已有众多成果。研究表明,E2基因序列的变异率在3%-25%,是猪瘟病毒基因中变异较大的之一。E2基因编码的E2蛋白含有5个N-糖基化位点,由于糖基化的程度不同,分子量范围51-58kDa,蛋白的有无糖基化对猪瘟病毒的毒力和免疫原性有很重要的影响。E2蛋白含有4个抗原结构,A区、B区、C区和D区,是猪瘟病毒一种主要的抗原结构蛋白,存在于病毒粒子的表面,保守性相对较低,相对容易变异,能诱导机体产生中和抗体,抵御强毒猪瘟病毒的攻击。通过对E2基因特定区域核苷酸序列及编码氨基酸序列进行测定和变异分析,并构建遗传进化树,可追溯猪瘟病毒的起源。
然而,目前的研究仍存在一些不足与空白。虽然对猪瘟病毒E2基因的研究较多,但对于我国部分地区出现的特定毒株,如HeN2F16株的研究还相对较少,对其基因特征、变异规律以及与其他毒株的亲缘关系等方面的了解还不够深入。在基因测定和分析方法上,也需要不断优化和创新,以提高研究的准确性和效率。不同地区猪瘟病毒的流行特点和基因变异情况存在差异,需要进一步加强对各地区毒株的监测和研究,为猪瘟的精准防控提供更全面的依据。
1.3研究目标与内容
本研究旨在通过对我国部分地区猪瘟E2及HeN2F16株的基因测定与分析,揭示其基因特征和变异规律,为猪瘟的防控提供科学依据。具体研究内容如下:
基因序列测定:采集我国部分地区疑似感染猪瘟的猪只样本,提取病毒RNA,通过RT-PCR技术扩增E2基因及HeN2F16
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