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10·32·中国药理学通报ChinesePharmacologicalBulletin2025Jun;41(6):1032~40

网络出版时间:2025-05-2910:14:20网络出版地址:https://link.cnki.net/urlid/34.1086.R1706.012

单细胞技术或靶标确证技术专题

基于靶标确证与单细胞多组学的天然产物机制研究进展

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陈娜娜,杜昊杰,孙洋

(1.南京中医药大学药学院,2.南京大学生命科学学院生物技术与药学系,

医药生物技术全国重点实验室,江苏南京210023)

doi:10.12360/CPB202412094药物靶点的识别及相关研究在药物研究领域具有重要

文献标识码:A文章编号:1001-1978(2025)06-1032-09的理论意义和实用价值。天然产物的活性小分子新靶点的

中国图书分类号:R2841;R319;R341;R394;R9776发现也将为相关疾病的治疗开辟广阔的研究空间。目前,天

摘要:天然产物是新药研发的宝库,越来越多的天然产物在然产物靶点的鉴定在生物医学领域变得越来越重要,鉴定方

各种疾病中显示出巨大的治疗潜力。单细胞多组学技术包法也多种多样,各有优缺点,选择合适的方式或多种方式联

括单细胞基因组学、单细胞转录组学、单细胞蛋白质组学、单合使用,可以提高识别的准确性。

细胞表观组学等,是对单个细胞进行多方面分析和研究的方1靶标识别

法,能够获得更全面、更准确的单细胞数据,在天然产物靶标1.1基于标记的化学蛋白质组学小分子与亲和探针偶联

领域研究提供了更深入的视角。该文总结了用于识别和验是发现和识别药物靶点的主要途径之一。小分子探针主要

证天然产物靶点的方法和新兴技术,并总结了新兴技术如单由报告基团、连接基团和活性基团组成。其中小分子的活性

细胞多组学和人工智能在天然产物药理学研究中的应用。基团部分会与其靶标紧密结合,而报告基团部分可以有效地

通过将靶标识别和单细胞多组学的最新研究技术结合,更深标记靶标生物大分子,通过荧光成像或者富集技术,对作用

的靶蛋白进行鉴定。

入地阐明天然产物的作用机制,加速中医药的创新并推动其

目前,常应用于靶标识别的小分子探针包括与亲和磁珠

产业化和国际化。

共价结合、生物素修饰、生物正交化学反应、光亲和基团探针

等方法(Fig1)。

关键词:天然产物;靶标识别;靶标验证;单细胞多组学;小分

1.1.1亲和磁珠偶联亲和磁珠偶联是一种识别目标蛋白

子探针;人工智能

的开创性方法,通过将天然产物连接上亲和磁珠,然后固定

在基质上,如琼脂糖珠或其他树脂。通过富集可与天然产物

开放科学(资源服务)标识码(OSID):结合的靶标蛋白,结合质谱进行鉴定。该方法具有快速、高

通量富集目的蛋白的优点。

Li等[1]通过将青蒿琥酯与亲和磁珠偶联,并在有无竞

天然产物是新药研发的重要来源之一。目前,临床药物争性游离蒿甲醚的情况下在aTC1细胞中进行下拉实验,结

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