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权重共表达WGCNA模块测试试题库及答案

一、单项选择题（每题2分，共10题）

1.WGCNA中用于构建共表达网络的主要数据类型是？

A.蛋白质序列B.基因表达量C.代谢物浓度D.细胞形态

答案：B

2.WGCNA构建网络时默认使用的相似性度量是？

A.欧氏距离B.皮尔逊相关系数C.余弦相似度D.曼哈顿距离

答案：B

3.在WGCNA中，模块通常用什么表示？

A.颜色B.数字C.字母D.符号

答案：A

4.确定软阈值功率的常用方法是？

A.随机选择B.观察无标度拓扑拟合指数C.取固定值D.按样本数量确定

答案：B

5.WGCNA分析中，用于鉴定模块枢纽基因的是？

A.基因连通性B.基因长度C.基因表达均值D.基因甲基化水平

答案：A

6.以下哪个不是WGCNA可用于的研究目的？

A.发现新基因功能B.分析基因进化关系C.识别共表达模块D.寻找疾病相关基因模块

答案：B

7.构建WGCNA网络时，数据预处理一般不包括？

A.标准化B.缺失值处理C.基因注释D.离群值处理

答案：C

8.软阈值的作用主要是？

A.过滤低表达基因B.调整网络的连通性C.确定样本数量D.划分基因功能类别

答案：B

9.在WGCNA中，模块与性状关联分析通常用？

A.卡方检验B.相关性分析C.t检验D.方差分析

答案：B

10.WGCNA软件包在哪个编程语言环境中使用？

A.C++B.PythonC.RD.Java

答案：C

二、多项选择题（每题2分，共10题）

1.以下哪些属于WGCNA构建网络的步骤？

A.数据预处理B.计算基因相似性C.聚类分析D.模块划分

答案：ABCD

2.选择软阈值功率时考虑的因素有？

A.无标度拓扑结构B.网络连通性C.基因表达范围D.样本数量

答案：AB

3.下列关于WGCNA模块的描述正确的是？

A.模块内基因高度共表达B.不同模块基因功能可能不同C.模块可通过颜色区分D.模块数量固定

答案：ABC

4.WGCNA可用于分析的数据来源有？

A.RNA-seqB.芯片数据C.蛋白质组数据D.代谢组数据

答案：AB

5.鉴定枢纽基因的意义在于？

A.了解模块核心功能B.发现潜在治疗靶点C.确定基因表达调控关系D.简化数据分析

答案：ABC

6.数据预处理过程中可能包括？

A.去除低质量样本B.对数转换C.批次效应校正D.基因排序

答案：ABC

7.构建WGCNA网络时可以调整的参数有？

A.软阈值B.聚类方法C.相似性度量方式D.模块合并阈值

答案：ABCD

8.以下哪些方法可用于可视化WGCNA结果？

A.热图B.网络图C.柱状图D.散点图

答案：AB

9.模块与性状关联分析可能用到的统计方法有？

A.线性回归B.偏相关分析C.逻辑回归D.主成分分析

答案：ABC

10.关于WGCNA的优势，正确的是？

A.能挖掘基因间复杂关系B.可用于多种组学数据C.不需要先验知识D.结果直观易懂

答案：ABC

三、判断题（每题2分，共10题）

1.WGCNA只能分析基因表达数据。（）

答案：×

2.软阈值越大，网络连通性越强。（）

答案：×

3.模块内所有基因功能都完全相同。（）

答案：×

4.构建WGCNA网络不需要进行数据标准化。（）

答案：×

5.枢纽基因在模块中连通性较低。（）

答案：×

6.模块划分后不能再进行调整。（）

答案：×

7.共表达网络中边的权重都相同。（）

答案：×

8.可以用WGCNA分析基因与环境因素的关联。（）

答案：√

9.聚类分析是WGCNA构建网络的必要步骤。（）

答案：√

10.WGCNA分析结果受样本量影响不大。（）

答案：×

四、简答题（每题5分，共4题）

1.简述WGCNA构建共表达网络的基本流程。

答案：先进行数据预处理，包括标准化等。接着计算基因间相似性，常用皮尔逊相关系数。通过聚类分析划分模块，根据基因表达模式将相似基因聚为一类，再进行模块与性状关联分析等后续研究。

2.为什么要确定软阈值功率？

答案：软阈值功率用于调整网络的连通性，合适的软阈值能使构建的网络符合无标度拓扑结构，保证网络的生物学合理性和