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全基因组重测序深度设定试题库及答案
一、单项选择题(每题2分,共10题)
1.一般人类全基因组重测序推荐深度是?
A.5XB.10XC.30XD.100X
2.全基因组重测序深度与什么密切相关?
A.测序成本B.测序仪器品牌C.样本数量D.分析软件
3.若要检测低频变异,重测序深度应?
A.降低B.不变C.提高D.随意
4.微生物全基因组重测序深度一般?
A.低于人类B.高于人类C.与人类相同D.不确定
5.全基因组重测序深度影响数据的?
A.颜色B.准确性C.测序日期D.样本来源
6.以下哪个因素不影响重测序深度设定?
A.研究目的B.样本质量C.测序平台D.实验人员性别
7.植物全基因组重测序深度通常?
A.比动物低B.比动物高C.与动物一样D.无法比较
8.设定合适深度能有效降低?
A.实验趣味性B.假阳性结果C.样本DNA量D.测序速度
9.全基因组重测序深度的单位是?
A.bpB.XC.%D.g
10.肿瘤全基因组重测序深度一般要求?
A.较低B.适中C.较高D.无要求
答案:1.C2.A3.C4.A5.B6.D7.A8.B9.B10.C
二、多项选择题(每题2分,共10题)
1.设定全基因组重测序深度需考虑的因素有?
A.研究物种B.变异检测类型C.预算D.数据库大小
2.以下哪些情况可能需要较高重测序深度?
A.寻找罕见变异B.新物种基因组研究C.验证已知变异D.检测大片段缺失
3.全基因组重测序深度与哪些方面有关?
A.数据量B.测序错误率C.覆盖度D.碱基质量
4.影响全基因组重测序深度设定的实验因素有?
A.样本DNA浓度B.文库构建方法C.测序读长D.分析算法
5.合适的重测序深度能带来的好处有?
A.提高变异检测准确性B.降低数据分析难度C.减少实验时间D.增加测序成本
6.对于以下哪些研究目标可能需要不同深度设定?
A.遗传疾病诊断B.物种进化分析C.作物品种改良D.微生物耐药性研究
7.全基因组重测序深度设定会受到以下哪些限制?
A.测序技术B.计算机性能C.实验人员操作D.样本可获得性
8.选择合适重测序深度的意义在于?
A.优化资源利用B.保证研究结果可靠性C.提升测序效率D.便于数据共享
9.以下哪些因素可能导致重测序深度不足?
A.样本DNA降解B.测序仪器故障C.文库质量差D.分析参数错误
10.全基因组重测序深度与以下哪些指标相关?
A.基因组大小B.变异频率C.测序通量D.碱基组成
答案:1.ABC2.ABD3.ABCD4.ABC5.AB6.ABCD7.ABD8.ABC9.ABC10.ABC
三、判断题(每题2分,共10题)
1.全基因组重测序深度越高越好。()
2.设定重测序深度无需考虑物种差异。()
3.测序成本与重测序深度呈正相关。()
4.重测序深度只影响变异检测结果。()
5.所有研究目的对全基因组重测序深度要求相同。()
6.样本质量不会影响重测序深度设定。()
7.合适深度可提高全基因组重测序数据质量。()
8.降低重测序深度一定能减少假阳性。()
9.全基因组重测序深度可以随意设定。()
10.新物种研究通常需要较高重测序深度。()
答案:1.×2.×3.√4.×5.×6.×7.√8.×9.×10.√
四、简答题(每题5分,共4题)
1.简述设定全基因组重测序深度需考虑的主要因素。
答案:需考虑研究目的,如检测罕见变异需高深度;研究物种,不同物种要求有别;预算,深度越高成本越高;样本质量,质量差可能需更高深度保证数据质量。
2.为什么肿瘤全基因组重测序深度要求较高?
答案:肿瘤基因组存在高度异质性,有大量体细胞变异,且可能存在低频变异。较高深度有助于准确检测各种变异,为肿瘤诊断、治疗和研究提供可靠依据。
3.全基因组重测序深度对变异检测有何影响?
答案:深度低可能遗漏变异,尤其是低频变异,假阴性增加;深度过高会增加成本和数据分析量,还可能因错误累积增加假阳性,合适深
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