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全基因组重测序深度设定试题库及答案

一、单项选择题(每题2分,共10题)

1.一般人类全基因组重测序推荐深度是?

A.5XB.10XC.30XD.100X

2.全基因组重测序深度与什么密切相关?

A.测序成本B.测序仪器品牌C.样本数量D.分析软件

3.若要检测低频变异,重测序深度应?

A.降低B.不变C.提高D.随意

4.微生物全基因组重测序深度一般?

A.低于人类B.高于人类C.与人类相同D.不确定

5.全基因组重测序深度影响数据的?

A.颜色B.准确性C.测序日期D.样本来源

6.以下哪个因素不影响重测序深度设定?

A.研究目的B.样本质量C.测序平台D.实验人员性别

7.植物全基因组重测序深度通常?

A.比动物低B.比动物高C.与动物一样D.无法比较

8.设定合适深度能有效降低?

A.实验趣味性B.假阳性结果C.样本DNA量D.测序速度

9.全基因组重测序深度的单位是?

A.bpB.XC.%D.g

10.肿瘤全基因组重测序深度一般要求?

A.较低B.适中C.较高D.无要求

答案:1.C2.A3.C4.A5.B6.D7.A8.B9.B10.C

二、多项选择题(每题2分,共10题)

1.设定全基因组重测序深度需考虑的因素有?

A.研究物种B.变异检测类型C.预算D.数据库大小

2.以下哪些情况可能需要较高重测序深度?

A.寻找罕见变异B.新物种基因组研究C.验证已知变异D.检测大片段缺失

3.全基因组重测序深度与哪些方面有关?

A.数据量B.测序错误率C.覆盖度D.碱基质量

4.影响全基因组重测序深度设定的实验因素有?

A.样本DNA浓度B.文库构建方法C.测序读长D.分析算法

5.合适的重测序深度能带来的好处有?

A.提高变异检测准确性B.降低数据分析难度C.减少实验时间D.增加测序成本

6.对于以下哪些研究目标可能需要不同深度设定?

A.遗传疾病诊断B.物种进化分析C.作物品种改良D.微生物耐药性研究

7.全基因组重测序深度设定会受到以下哪些限制?

A.测序技术B.计算机性能C.实验人员操作D.样本可获得性

8.选择合适重测序深度的意义在于?

A.优化资源利用B.保证研究结果可靠性C.提升测序效率D.便于数据共享

9.以下哪些因素可能导致重测序深度不足?

A.样本DNA降解B.测序仪器故障C.文库质量差D.分析参数错误

10.全基因组重测序深度与以下哪些指标相关?

A.基因组大小B.变异频率C.测序通量D.碱基组成

答案:1.ABC2.ABD3.ABCD4.ABC5.AB6.ABCD7.ABD8.ABC9.ABC10.ABC

三、判断题(每题2分,共10题)

1.全基因组重测序深度越高越好。()

2.设定重测序深度无需考虑物种差异。()

3.测序成本与重测序深度呈正相关。()

4.重测序深度只影响变异检测结果。()

5.所有研究目的对全基因组重测序深度要求相同。()

6.样本质量不会影响重测序深度设定。()

7.合适深度可提高全基因组重测序数据质量。()

8.降低重测序深度一定能减少假阳性。()

9.全基因组重测序深度可以随意设定。()

10.新物种研究通常需要较高重测序深度。()

答案:1.×2.×3.√4.×5.×6.×7.√8.×9.×10.√

四、简答题(每题5分,共4题)

1.简述设定全基因组重测序深度需考虑的主要因素。

答案:需考虑研究目的,如检测罕见变异需高深度;研究物种,不同物种要求有别;预算,深度越高成本越高;样本质量,质量差可能需更高深度保证数据质量。

2.为什么肿瘤全基因组重测序深度要求较高?

答案:肿瘤基因组存在高度异质性,有大量体细胞变异,且可能存在低频变异。较高深度有助于准确检测各种变异,为肿瘤诊断、治疗和研究提供可靠依据。

3.全基因组重测序深度对变异检测有何影响?

答案:深度低可能遗漏变异,尤其是低频变异,假阴性增加;深度过高会增加成本和数据分析量,还可能因错误累积增加假阳性,合适深

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