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算法在宇宙能量-中药代谢研究中的深度应用

金立成

第八章跨尺度建模与系统集成算法

8.1多尺度物理-生物耦合模型

8.1.1从宇宙射线到分子响应的全链条建模

宇宙能量影响中药代谢的完整链条涉及多个物理尺度和生物组织层次。我们设计了一个分层建模框架：

```python

classMultiScaleCosmicPlantModel:

多尺度宇宙-植物耦合模型

def__init__(self):

物理传输层：宇宙射线在大气中的传播与衰减

self.cosmic_ray_transport=CosmicRayTransportModel()

组织剂量计算层：计算植物器官接收的辐射剂量

self.dose_calculator=PlantTissueDoseCalculator()

分子响应层：DNA损伤与修复动力学

self.dna_damage_model=DNARepairKineticsModel()

信号转导层：ROS信号传递与基因调控

self.signal_transduction=ROSSignalTransductionNetwork()

代谢网络层：代谢通量重分配

self.metabolic_network=PlantMetabolicFluxModel()

表型整合层：生长与代谢物积累

self.phenotype_integrator=PhenotypeIntegrationModel()

defsimulate_scenario(self,cosmic_flux,plant_params,duration_days):

模拟特定宇宙能量场景下的植物响应

results={}

逐层计算

1.物理传输

ground_level_flux=self.cosmic_ray_transport.transport(

cosmic_flux,atmospheric_conditions

)

2.剂量计算

organ_doses={}

fororganin[root,stem,leaf,flower]:

organ_doses[organ]=self.dose_calculator.calculate(

ground_level_flux,

plant_params[geometry][organ],

plant_params[density][organ]

)

3.分子损伤

dna_damage_rates=self.dna_damage_pute_damage_rate(

organ_doses[leaf]以叶片为例

)

4.信号激活

ros_signals=self.signal_transduction.activate(

dna_damage_rates,

plant_params[antioxidant_capacity]

)

5.代谢重编程

metabolic_shifts=self.metabolic_network.reprogram(

ros_signals,

plant_params[metabolic_baseline]

)

6.时间积分

daily_changes=[]

current_state=plant_params[initial_state]

fordayinrange(duration_days):