脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术在一起肠炎沙门氏菌食源性疾病暴发中的溯源分析.docx

研究报告

PAGE

1-

脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术在一起肠炎沙门氏菌食源性疾病暴发中的溯源分析

一、背景介绍

1.肠炎沙门氏菌食源性疾病概述

(1)肠炎沙门氏菌（Salmonellaenterica）是一种常见的食源性致病菌，广泛存在于人类和动物宿主体内。根据国际食品安全机构的统计，肠炎沙门氏菌是全球范围内导致食源性疾病的五大主要病原体之一。每年全球因感染肠炎沙门氏菌而发病的人数达到数十万，严重病例可导致死亡。在发达国家，肠炎沙门氏菌引起的食源性疾病占所有食源性疾病的比例约为10%，而在发展中国家，这一比例可能更高。例如，美国疾病控制与预防中心（CDC）数据显示，2019年美国共报告了大约25,000例由肠炎沙门氏菌引起的食源性疾病病例。

(2)肠炎沙门氏菌感染主要通过摄入被污染的食物或水传播。这些食物可能包括生或未煮熟的肉类、蛋类、乳制品以及蔬菜水果等。在特定的暴发事件中，肠炎沙门氏菌污染的食物可能仅为某一特定产品或批次。例如，2011年美国密歇根州发生的沙门氏菌O157:H7疫情，就与某品牌洋葱粉的污染有关，导致超过400人感染。此外，环境污染也是肠炎沙门氏菌传播的重要途径，动物粪便、污水和土壤都可能成为该菌的传播媒介。

(3)肠炎沙门氏菌感染的典型症状包括腹泻、发热、呕吐和头痛等。症状的严重程度因个体差异和感染菌株而异。在一般情况下，感染者的症状会在几周内自行缓解，但老年人、婴幼儿和免疫力低下的人群感染后可能发展为严重的并发症，如败血症、脑膜炎等。根据世界卫生组织（WHO）的统计，每年因肠炎沙门氏菌感染导致的死亡人数约为4万，其中大多数发生在发展中国家。此外，肠炎沙门氏菌感染不仅给患者带来健康威胁，还对全球经济造成巨大损失。据统计，全球每年因食源性疾病导致的直接经济损失高达95亿美元。

2.脉冲场凝胶电泳（PFGE）技术简介

(1)脉冲场凝胶电泳（Pulsed-fieldgelelectrophoresis，PFGE）是一种分子生物学技术，主要用于分析细菌染色体DNA的限制性内切酶酶切图谱。该技术由美国加州大学伯克利分校的Lior和Heidelberg于1989年首次提出，并在细菌分类和流行病学研究中迅速得到广泛应用。PFGE通过在电泳过程中引入脉冲场，使DNA分子在垂直和平行方向上同时受到电场力作用，从而克服了传统电泳中DNA分子在单一方向上的迁移限制，实现了对DNA分子更大范围和更高分辨率的分离。PFGE技术的这一独特优势使其成为细菌分子分型的重要工具。

(2)PFGE技术的原理是利用特定限制性内切酶切割细菌染色体DNA，产生大小不同的DNA片段。这些片段随后在含有琼脂糖凝胶的脉冲场电泳槽中进行电泳分离。在脉冲场的作用下，DNA分子在垂直和平行方向上同时受到电场力作用，导致DNA分子在凝胶中形成复杂的三维网络结构，从而实现不同大小DNA片段的分离。PFGE图谱的分辨率取决于DNA片段的大小和电泳条件，一般而言，较小的DNA片段具有更高的分辨率。通过比较不同细菌的PFGE图谱，可以识别出具有相似遗传特征的细菌株，从而在细菌流行病学调查中发挥重要作用。

(3)PFGE技术具有以下特点：首先，PFGE图谱具有高度特异性，可以区分遗传差异较小的细菌株；其次，PFGE技术操作简便，只需对细菌染色体DNA进行简单的酶切、电泳和银染等步骤；第三，PFGE图谱易于保存和比较，便于进行细菌溯源和流行病学调查。然而，PFGE技术也存在一些局限性，如对某些细菌菌株的染色体DNA难以进行有效酶切，以及PFGE图谱的解读可能受到操作者经验的影响。尽管如此，PFGE技术仍被视为细菌分子分型的重要手段，广泛应用于细菌分类、耐药性监测、食源性疾病溯源等领域。随着分子生物学技术的不断发展，PFGE技术也在不断改进和完善，如结合数字图像分析、自动化操作等新技术，以提高PFGE技术的效率和准确性。

3.PFGE在食源性疾病溯源中的应用

(1)脉冲场凝胶电泳（PFGE）技术在食源性疾病溯源中扮演着至关重要的角色。通过分析食源性疾病患者的病原菌DNA图谱，PFGE能够揭示不同病例之间是否存在共同的来源，从而帮助公共卫生机构迅速追踪和消除食源性疾病的风险。例如，在沙门氏菌食源性疾病暴发事件中，PFGE可以帮助确定污染源是单一的食物供应商还是多个供应商，进而指导卫生部门采取针对性的防控措施。

(2)PFGE技术通过产生独特的DNA指纹图谱，为食源性疾病溯源提供了强有力的证据。这种指纹图谱的特异性使得即使在大量样本中，也能够精确地识别出同一种病原菌的不同菌株。在复杂的食源性疾病暴发事件中，PFGE技术能够帮助研究人员快速缩小调查范围，提高溯源效率。此外，PFGE图谱的稳定性和可重复性，使得不同时间、不同地点采集的