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2026年基因表达谱数据分析试题含答案

一、选择题（共10题，每题2分，共20分）

1.在基因表达谱数据分析中，以下哪种方法最适合用于检测差异表达基因（DEG）？

A.t-检验

B.Wilcoxon秩和检验

C.线性回归分析

D.逻辑回归分析

2.微阵列（microarray）和RNA测序（RNA-seq）在基因表达谱数据采集中的主要区别是什么？

A.微阵列只能检测已知基因，RNA-seq可检测所有RNA分子

B.微阵列成本更低，RNA-seq成本更高

C.微阵列数据分辨率更高，RNA-seq数据噪声更大

D.微阵列适用于高通量，RNA-seq适用于低通量

3.在差异表达基因筛选中，调整p值常用的方法是？

A.Bonferroni校正

B.Benjamini-Hochberg方法

C.Fisher精确检验

D.Mann-WhitneyU检验

4.基因表达谱聚类分析中，常用的距离度量方法包括？

A.欧氏距离

B.曼哈顿距离

C.余弦相似度

D.以上都是

5.GSEA（基因集富集分析）的核心思想是什么？

A.检测单个基因的显著性

B.评估已知生物学通路在样本中的富集程度

C.对基因进行分类

D.计算基因表达变化的方向

6.在处理基因表达谱数据时，批次效应（batcheffect）的主要来源是什么？

A.样本差异

B.实验操作不一致

C.软件算法差异

D.基因本身的变异

7.RNA-seq数据中，FPKM（FragmentsPerKilobaseoftranscriptperMillionmappedreads）主要用于？

A.比较不同样本的基因表达量

B.计算基因转录本的丰度

C.评估测序深度

D.校正基因长度差异

8.在时间序列基因表达谱分析中，常用的模型包括？

A.线性回归模型

B.ARIMA模型

C.状态空间模型

D.以上都是

9.基因表达谱数据标准化常用的方法包括？

A.中位数缩放

B.Z-score标准化

C.TPM（TranscriptsPerMillion）

D.以上都是

10.在基因表达谱分析中，什么是“假发现率”（FDR）？

A.真实差异表达基因中被错误标记的比例

B.总差异表达基因中假阳性基因的比例

C.真实非差异表达基因中被错误标记的比例

D.总非差异表达基因中假阳性基因的比例

二、填空题（共10题，每题1分，共10分）

1.差异表达基因（DEG）筛选中，p值越小，表示基因差异越______。

2.基因表达谱聚类分析中，常用的算法包括______和层次聚类。

3.GSEA分析中，常用的参考基因集数据库是______。

4.RNA-seq数据中，TPM的公式是______。

5.批次效应的校正方法包括______和置换检验。

6.时间序列基因表达谱分析中，常用的趋势检测方法包括______和局部回归。

7.基因表达谱数据标准化中，中位数缩放方法的主要思想是______。

8.基因表达谱分析中，常用的统计检验方法包括______和t-检验。

9.基因表达谱聚类分析中，常用的距离度量方法包括______和曼哈顿距离。

10.基因表达谱数据可视化中，常用的工具包括______和热图。

三、简答题（共5题，每题6分，共30分）

1.简述RNA-seq数据标准化方法的原理和优缺点。

2.解释什么是批次效应，并列举两种校正批次效应的方法。

3.描述GSEA分析的基本步骤和主要用途。

4.说明基因表达谱聚类分析的步骤和意义。

5.比较微阵列和RNA-seq在基因表达谱数据分析中的优缺点。

四、计算题（共3题，每题10分，共30分）

1.某研究比较了两组样本（A组和B组）的基因表达谱，结果如下表所示。请计算基因X在两组间的FoldChange（FC）和p值（假设使用t-检验，α=0.05）。

|基因|A组表达量|B组表达量|

||--|--|

|X|10|20|

|Y|5|5|

|Z|15|5|

2.某研究进行GSEA分析，发现某个生物学通路在疾病组中显著富集（p=0.01，FDR=0.05）。请解释FDR的含义，并说明该结果是否具有统计学意义。

3.某研究使用RNA-seq技术检测了三组样本（对照组、处理组1、处理组2）的基因表达谱，数据如下表所示。请使用层次聚类方法对样本进行分组，并说明聚类结果的生物学意义。

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