一株牛源都柏林沙门氏菌的全基因组测序及毒力与耐药性分析.docxVIP

研究报告

PAGE

1-

一株牛源都柏林沙门氏菌的全基因组测序及毒力与耐药性分析

一、研究背景

1.1.牛源都柏林沙门氏菌的流行病学特征

(1)牛源都柏林沙门氏菌作为一种重要的食源性致病菌，在全球范围内广泛存在，尤其在发展中国家，其感染病例呈现逐年上升的趋势。根据世界卫生组织（WHO）的报告，每年约有7亿人因食源性病原体感染而患病，其中都柏林沙门氏菌是常见的病原之一。据统计，在食源性病原菌引起的疾病中，都柏林沙门氏菌引起的病例占比约为10%-20%。以我国为例，根据国家食品安全风险评估中心的监测数据显示，2019年全国共报告食源性致病菌感染病例4.5万例，其中由都柏林沙门氏菌引起的病例超过5000例。

(2)牛源都柏林沙门氏菌的感染主要发生在婴幼儿、老年人、免疫力低下的人群中。据美国疾病控制与预防中心（CDC）统计，美国每年约有1.2万例由都柏林沙门氏菌引起的感染病例，其中约40%的患者为65岁以上的老年人。婴幼儿感染病例也较为常见，据统计，美国每年约有4000名婴幼儿感染都柏林沙门氏菌。此外，都柏林沙门氏菌的感染病例在季节性上也具有一定的规律性，通常在夏季和秋季较为高发。

(3)牛源都柏林沙门氏菌的感染途径主要是通过食用被污染的食品，如生肉、蛋类、奶制品等。近年来，随着全球化和国际贸易的发展，食品供应链的复杂性不断增加，都柏林沙门氏菌的传播途径也更加多样化。例如，2018年英国爆发的一起由都柏林沙门氏菌引起的食源性疾病事件，就是由于一家肉类加工厂的产品污染所致。这起事件导致超过300人感染，其中多人住院治疗。此外，都柏林沙门氏菌还可以通过水源、土壤等途径传播，给公共卫生安全带来严重威胁。

2.2.都柏林沙门氏菌的毒力因子

(1)都柏林沙门氏菌的毒力因子是其感染宿主并导致疾病的关键因素。研究表明，该菌的毒力因子主要包括侵袭性蛋白、毒素和细胞因子等。例如，侵袭相关蛋白Ipa和Ipg家族在细菌侵入宿主细胞过程中发挥重要作用。据研究，Ipa家族中的IpaB、IpaC、IpaD和IpgD蛋白在细菌侵入过程中分别与宿主细胞骨架蛋白结合，促进细菌与细胞的粘附和内吞。以2008年美国一起由都柏林沙门氏菌引起的爆发为例，通过对患者样本的测序分析，发现Ipa家族蛋白的表达水平与疾病的严重程度呈正相关。

(2)毒素是都柏林沙门氏菌引起宿主细胞损伤的关键因素之一。其中，毒素A（ToxA）和毒素B（ToxB）是最重要的毒素蛋白。毒素A是一种分泌型毒素，可以破坏宿主细胞的细胞膜，导致细胞死亡。毒素B则是一种肠毒素，可以引起肠道炎症和腹泻等症状。在2015年欧洲爆发的一起由都柏林沙门氏菌引起的食源性疾病事件中，通过对患者样本的检测，发现毒素A和毒素B的存在与患者的临床症状密切相关。

(3)除了侵袭性和毒素，都柏林沙门氏菌还产生多种细胞因子，如脂多糖（LPS）、细胞因子激活蛋白（CyaA）等。这些细胞因子可以调节宿主的免疫反应，帮助细菌在宿主体内生存和传播。例如，细胞因子激活蛋白CyaA可以激活宿主细胞内的信号传导途径，导致细胞死亡或凋亡。在2016年澳大利亚爆发的一起由都柏林沙门氏菌引起的食源性疾病事件中，研究人员发现CyaA的表达水平与患者的临床病情严重程度密切相关。这些研究表明，都柏林沙门氏菌的毒力因子在细菌感染过程中起着至关重要的作用。

3.3.都柏林沙门氏菌的耐药性问题

(1)都柏林沙门氏菌的耐药性问题日益严重，已成为全球公共卫生的严峻挑战。随着抗生素的广泛使用，细菌耐药性逐渐增加，使得原本有效的抗生素治疗变得困难。据世界卫生组织（WHO）报告，全球约有70%的革兰氏阴性菌对至少一种抗生素表现出耐药性。在沙门氏菌中，都柏林沙门氏菌的耐药性尤为突出。例如，2019年一项针对全球27个国家的调查发现，都柏林沙门氏菌对氨苄西林、氯霉素、四环素等抗生素的耐药率分别高达50%、30%和20%。

(2)都柏林沙门氏菌的耐药性不仅限于单一抗生素，而是呈现出多重耐药性。这意味着细菌对多种抗生素同时表现出抗性，使得治疗选择变得极为有限。2017年，美国疾病控制与预防中心（CDC）报告了一起由都柏林沙门氏菌引起的多重耐药性感染病例，该菌株对氨苄西林、四环素、链霉素等多种抗生素均表现出耐药性。此外，研究发现，都柏林沙门氏菌对第三代头孢菌素、氟喹诺酮类等抗生素的耐药率也在逐年上升。

(3)耐药性问题的产生与抗生素的滥用和不当使用密切相关。在农业领域，抗生素作为促生长剂在动物饲料中的使用，导致细菌耐药基因在动物肠道内传播，并通过食物链传递给人类。2016年，一项针对全球14个国家的研究发现，从鸡肉、猪肉和牛肉中分离出的都柏林沙门氏菌中，约60%的菌株携带耐药基因。此外，医院环境中的抗生素滥用也是导致耐药性增加的重要因素。例如，