《微生物学》微生物的分类.pptxVIP

微生物的分类;

第一节微生物分类的概念

第二节微生物的进化与分类

第三节微生物分类单元与分类等级第四节微生物的命名

第五节原核微生物的分类

第六节真菌的分类

第七节病毒的分类

第八节微生物的分离纯化与保藏;

—→PARTONEe-—→

第一节微生物分类的概念;

1、微生物分类

微生物分类主要包括分类、鉴定与命名

三个环节，是按微生物亲缘关系把微生物归入各分类单元或分类群(taxon),以

得到一个反映微生物进化的自然分类和

符合逻辑命名的系统。另外，微生物的

分类还涉及微生物的分离、描述、菌种保藏等等。;

PARTONE微生物分类的概念

分类(taxonomy)是根据一定的原则(特征的相似性、系统发育的相关性)对微生物进行分群归类，根据相似性或相关性水平排列成系统，并对各个分类群的特征进行描述，以便于查考和对未分类的微生物进

行鉴定。

鉴定(identification)是将某一特定生物归属于已确定的某一分类单元

的过程。

三、命名(nomenclature)是将不同的分类单元赋予规则相符的名称。;

PARTONE微生物分类的概念

对微生物进行分类主要从如下几个层面进行：

(1)形态特征

(2)生理生化特征

(3)代谢特征

(4)化学分类特征

(5)遗传和分子特征

(6)全基因组序列特征;

→PARTTWO——

第二节微生物的进化与分类;

PARTTWO微生物的进化与分类

在生物进化和微生物系统发育的研究中，研究学者们使用一种树状图

体现各种生物间的亲缘关系，并将其称为系统进化树。

微生物系统树的构建是以待测菌株的16SrDNA全长序列为目标，通

过专业软件进行系统进化树的构建。;

PARTTWO微生物的进化与分类

MEGA软件，现已出版MEGAX:

MEGA软件使用起来非常方便，可以通过邻位相接法(Neigbor-

joining,NJ)、最大似然法(Maximum-likelihood,ML)和最大简约法(Maximum-parsimony,MP)的计算来获得相应系统进化树，再通过进一步比对分析待测菌株的初步系统分类地位。;

PARTTWO微生物的进化与分类

有一些学者发现，16SrRNA基因在原核生物中存在多拷贝及异质性，

当用16SrRNA来评价微生物的多样性时，会出现高估的现象。

目前系统发育分析除了使用16SrRNA构建系统发育树外，很多研究学

者还广泛使用一些看家基因、多位点序列分析等方法作为辅助分析。;

PARTTWO微生物的进化与分类

第四域生物?

2016年5月4日，美国加利福尼亚州大学戴维斯分校基因研究中心

的乔纳森·艾森教授在《科学画报》上报道了，某些采自海水中的生物样本的基因序列与我们目前已知的基因序列完全不同，地球上可能存在着三域之外的第四域生物。

但也有学者提出质疑，认为应该进一步分析该类基因是否由于快速

进化或来自携带奇异基因组的已知微生物。;

PARTTWO微生物的进化与分类

微生物模式菌株保藏

主要藏机构举例：国际保藏机构举例

中国典型培养物保藏中心(CCTCC)

中国普通微生物菌种保藏中心(CGMCC)捷克微生物保藏中心(CCM)

法国国家微生物菌种保藏中心(CNCM)

日本典型培养物保藏中心(JCM)

美国典型培养物保藏中心(ATCC)德国微生物保藏中心(DSMZ);

e—→PARTTHREEe————

第三节微生物分类单元与分类等级;

分类单元(taxa)是指具体的分类群，如细菌域(Bacteira)、放

线菌目(Actinomycetales)、红球菌属(Rhodococcus)等就分

别代表一个分类单元。

分类等级，按照域(domain)、界(kingdom)、门(division/phylum)、

纲(class)、目(order)、科(family)、属(genus)、种(species)进行划

分。;

菌株(strain)是指从自然界中分离得到的任何一种微生物的纯培养都可以称为微生物的一个菌株；用实验方法(如诱变)所获得的某一个菌株的变异，也可以称为一个新的菌株，以便于同原来的菌株区别。

型(form或type)常指亚种