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2026年计算生物学方法考试含答案

一、单选题（共10题，每题2分，计20分）

1.在基因表达谱数据分析中，用于识别差异表达基因的统计方法不包含以下哪一项？

A.t检验

B.ANOVA方差分析

C.Wilcoxon秩和检验

D.Fisher精确检验

2.在系统发育树构建中，以下哪种方法不属于基于距离的算法？

A.Neighbor-Joining

B.MaximumLikelihood

C.UPGMA

D.MinimumEvolution

3.在生物信息学数据库中，NCBI的GenBank数据库主要用于存储以下哪种类型的数据？

A.蛋白质序列

B.基因组序列

C.转录组数据

D.蛋白质结构

4.在RNA-seq数据分析中，用于去除低质量读数的工具是以下哪一项？

A.Samtools

B.Trimmomatic

C.GATK

D.Bowtie2

5.在蛋白质结构预测中，AlphaFold2所使用的核心算法是基于以下哪种模型？

A.聚类分析

B.神经网络

C.贝叶斯模型

D.支配分类

6.在系统生物学网络分析中，用于衡量网络节点重要性的指标不包含以下哪一项？

A.度中心性

B.熵权值

C.联合置信度

D.调控指数

7.在高通量测序数据质控中，用于评估测序平台准确性的指标是以下哪一项？

A.Q值

B.R值

C.F值

D.P值

8.在基因调控网络重建中，以下哪种方法不属于基于表达谱数据的算法？

A.PSSR

B.ARACNE

C.WGCNA

D.MAST

9.在代谢通路分析中，KEGG数据库主要用于存储以下哪种类型的数据？

A.蛋白质序列

B.基因组序列

C.代谢通路

D.蛋白质结构

10.在机器学习在生物信息学中的应用中，用于处理高维数据的降维方法不包含以下哪一项？

A.PCA

B.LDA

C.t-SNE

D.t-SNE

二、多选题（共5题，每题3分，计15分）

1.在基因功能注释中，以下哪些数据库可用于获取基因的功能信息？

A.GO

B.KEGG

C.Swiss-Prot

D.UniProt

E.PDB

2.在系统发育树可视化中，以下哪些软件可用于展示树状结构？

A.FigTree

B.iTOL

C.Jalview

D.MEGA

E.R

3.在RNA-seq数据分析中，以下哪些工具可用于差异表达基因的识别？

A.DESeq2

B.edgeR

C.limma

D.Samtools

E.GATK

4.在蛋白质结构预测中，以下哪些方法可用于评估预测结构的准确性？

A.GDT-TS

B.RMSD

C.TM-score

D.Q-score

E.C-score

5.在系统生物学网络分析中，以下哪些指标可用于衡量网络模块的分离度？

A.Modularity

B.AveragePathLength

C.ClusteringCoefficient

D.DegreeDistribution

E.NetworkDensity

三、填空题（共10题，每题1分，计10分）

1.在生物信息学中，_________数据库主要用于存储蛋白质序列和结构信息。

2.RNA-seq数据分析中，_________工具用于去除低质量读数。

3.系统发育树构建中，_________算法属于基于距离的算法。

4.蛋白质结构预测中，_________算法基于神经网络模型。

5.系统生物学网络分析中，_________指标用于衡量网络节点的中心性。

6.高通量测序数据质控中，_________指标用于评估测序平台的准确性。

7.基因调控网络重建中，_________方法基于表达谱数据。

8.代谢通路分析中，_________数据库主要用于存储代谢通路信息。

9.机器学习在生物信息学中的应用中，_________方法用于降维。

10.基因功能注释中，_________数据库用于获取基因的生物学过程信息。

四、简答题（共5题，每题4分，计20分）

1.简述RNA-seq数据分析的基本流程。

2.解释系统发育树在生物分类学研究中的作用。

3.描述蛋白质结构预测中AlphaFold2的核心算法。

4.说明系统生物学网络分析中模块度的概念及其意义。

5.阐述机器学习在生物信息学中的应用场景。

五、论述题（共1题，计25分）

1.结合实际案例，论述RNA-seq数据分析在疾病研究中的应用价值。

答案与解析

一、单选题

1.D

解析：Fisher精确检验主要用于2x2列联表分析，不适用于基因表达谱数据分析。

2.B

解析：MaximumLi