分子流行病学在疾病预防控制中的应用预防级讲课文档.pptVIP

PCR-RFLPPCR-SSCP,PCR-basedresequencingReal-timePCRMatrix-assistedlaserdesorption/ionizationtime-of-flight(MALDI)massspectrometryDynamicallele-specifichybridization(DASH)DNA-chipanalysisDHPLC单核苷酸多态性（SNP）检测技术第30页，共82页。illumina高通量基因分型平台第31页，共82页。SNPstream基因分型系统第32页，共82页。AutomatedLiquidHandlerSpectroPREPTMNanoliterDispenserSpectroJETTMMALDI-TOFMassSpectrometerSpectroREADERTMAutomatedAnalysisSpectroTYPERTMMiniaturizedBiochipSpectroCHIPTMMassARRAYIntegratedComponents第33页，共82页。核酸分子杂交第34页，共82页。蛋白质检测鉴定系统SDS第35页，共82页。酶联免疫吸附试验（ELISA）第36页，共82页。高效液相色谱(HPLC,LC/MS/MS)第37页，共82页。AccessibleGenomeandGeneticVariationdatabaseAffordableHigh-throughputPlatformService第38页，共82页。分子流行病学在疾病预防和控制中的应用（一）病因的探讨及病因致病机制的研究1、传染病病因及流行规律的探讨研究已知或新发传染病的病原体和流行特点病原学诊断（基因诊断）、基因分型研究分布特点，传染源追踪和传播途径确定观察病原体在体内持续时间和消长规律第39页，共82页。丙型肝炎病毒基因分型Simmonds双等级基因命名系统病原体基因分型不同基因型HCV，其临床表现以及对抗病毒治疗的敏感程度有显著差异。1b型对干扰素治疗的持续应答率为20%，而非1b型对干扰素治疗的持续应答率可达60-70%。第40页，共82页。1a,1b2a,2b,3a1a,1b2a,2b,2c,3a45a1b1b,61b,3a1b,3a3b4ClinicalMicrobiologyReviews,2000,13(2)223-235HCV1b型是我国主要流行型1a,1b,2b,3a2a第41页，共82页。如SARS在广东流行可分三个阶段:早期由病人分离到的SARS病毒与果子狸分离到的SARS病毒高度同源,因此怀疑SARS是一种动物来源的疾病。上海预防医学杂志2005SARS病毒来源及变异分析中期SARS病毒分子结构稳定,病毒传播力强,超级传播事件发生多。后期SARS病毒碱基缺失可达几百个，病毒的传播力大大减少。第42页，共82页。案例：1990年7月，美国佛罗里达州一名AIDS妇女，怀疑在当地一牙科诊所手术时感染了HIV，因为该诊所的牙科医生也是一名AIDS患者。随后当地卫生部门对该牙医诊治过的一千余名患者进行HIV检测，共发现7名HIV感染者有在该诊所的就诊史。那么这7名HIV感染者是否与该牙医有关呢？传染病传播途径分析Science1992第43页，共82页。针对这一问题可采取的分析方法：1、传统流行病学分析方法：接触者调查，分析感染者可能的危险行为如输血、静脉吸毒、不洁性交史等。2、分子流行病学方法：比较HIV病毒基因序列的差异，分析不同病例感染株遗传关系的远近。Science1992第44页，共82页。与牙医感染株的遗传变异性比较与对照感染株的遗传变异性比较第45页，共82页。病人D当地对照牙医及病人A,B,C,E,G病人F进化树分析第46页，共82页。以结核为例：与结核病人密切接触，感染和发病的危险增加。这些接触者与源病例之间，是否产生了结核分枝杆菌的传播？开展结核病成“簇”性研究，可以从分子角度解答这样的问题。成簇的过程就是用聚类分析对分离株的基因进行分型或分群的过程，可以分析结核病的传染源和传播途径。揭示传染病传播机制第47页，共82页。结核杆菌DNA指纹图谱有助于基因分型流行病学常用结核杆菌