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合成生物学高通量测序工程师岗位招聘考试试卷及答案

一、填空题（每题1分，共10分）

1.Illumina测序的核心原理是______。

2.基因组DNA片段化常用方法包括超声破碎和______。

3.RNA-seq中去除rRNA的方法有rRNA探针法和______。

4.测序数据QC常用工具是______。

5.基因组拼接常用软件举1例：______。

6.CRISPR编辑效率检测常用______测序。

7.单细胞RNA-seq捕获平台有10xGenomics和______。

8.亚硫酸氢盐处理将未甲基化的______转化为尿嘧啶。

9.测序文库接头的作用是______。

10.RNA-seq基因定量常用工具：______。

二、单项选择题（每题2分，共20分）

1.第三代长读长测序技术是？

A.IlluminaNovaSeqB.PacBioSMRTC.IonTorrentD.Sanger

2.文库末端修复不包括？

A.平末端化B.去突出端C.加A尾D.连接接头

3.导致RNA-seq偏差的操作是？

A.立即提RNAB.-80℃冻存C.室温放2hD.RNase-free试剂

4.用于序列比对的工具是？

A.FastQCB.TrimmomaticC.STARD.MultiQC

5.甲基化胞嘧啶经亚硫酸氢盐处理后______。

A.变尿嘧啶B.保持胞嘧啶C.变胸腺嘧啶D.降解

6.检测染色质开放区域的文库是？

A.ATAC-seqB.ChIP-seqC.RNA-seqD.WGBS

7.低质量reads的Phredscore通常低于？

A.10B.20C.30D.40

8.CRISPR筛选用______测序。

A.靶向B.全基因组C.外显子组D.单细胞

9.PacBio测序的特点是？

A.读长短B.无PCRbiasC.准确率99.9%D.通量高

10.单细胞RNA-seq的优势是？

A.群体平均表达B.检测细胞异质性C.成本极低D.通量极高

三、多项选择题（每题2分，共20分）

1.文库构建关键步骤包括？

A.片段化B.末端修复C.接头连接D.扩增E.质量检测

2.第二代测序特点是？

A.读长长B.通量高C.准确率高D.成本低E.无PCRbias

3.RNA-seq需要的酶是？

A.反转录酶B.DNA聚合酶C.RNA聚合酶D.RNaseHE.限制酶

4.单细胞RNA-seq应用包括？

A.细胞异质性B.稀有细胞鉴定C.基因表达谱D.甲基化检测E.变异分析

5.甲基化测序类型是？

A.WGBSB.RRBSC.ChIP-seqD.MeDIP-seqE.ATAC-seq

6.测序数据QC内容包括？

A.碱基质量B.GC含量C.接头污染D.序列长度E.比对率

7.变异检测工具是？

A.GATKB.SAMtoolsC.STARD.VarScanE.FastQC

8.CRISPR编辑检测内容包括？

A.编辑效率B.脱靶效应C.插入缺失D.基因表达E.甲基化

9.长读长测序优势是？

A.覆盖重复序列B.完整基因组拼接C.检测结构变异D.准确率高E.通量高

10.文库质量检测方法是？

A.琼脂糖电泳B.毛细管电泳C.qPCRD.分光光度计E.测序验证

四、判断题（每题2分，共20分）

1.Illumina读长比PacBio长。（×）

2.OligodT富集仅捕获polyA+RNA。（√）

3.未甲基化胞嘧啶经亚硫酸氢盐处理变胸腺嘧啶。（√）

4.FastQC用于序列比对。（×）

5.单细胞cDNA可直接测序。（×）

6.ChIP-seq检测蛋白-DNA互作。（√）

7.PCR扩增会引入碱基错误。（√）

8.10xGenomics可捕获数千个细胞。（√）

9.靶向测序成本比全基因组高。（×）

10.PacBioCCS可提高准确率。（√）

五、简答题（每题5分，共20分）

1.简述Illumina测序基本流程。

答案：①文库制备：DNA片段化→末端修复→加A尾→连接接头；②簇生成：flowcell上桥式PCR扩增形成DNA簇；③边合成边测序（SBS）：荧光标记dNTP合成碱基→激发荧光成像；④数据读取：解析荧光信号→生成FASTQ数据。

2.简述polyA+RNA-seq文库构建步骤。

答案：①总RNA提取；②oligodT磁珠捕获polyA+RNA；③RNA片段化（镁离子加热）；④反转录合成第一链cDNA；⑤第二链cDNA合成；⑥末端修复→加A尾→连接接头；⑦PCR扩增；⑧质量检测（电泳、qPCR）。

3.简述测序数据QC主要内容。

答案：①碱基质量：Phredscore分布（20为合格）；②序列长度：符合预期；③GC含量：与参考一致；④接头污染：残留量低；⑤duplication率：PCR重复比例；⑥比对率：与参考基因组比对情况。

4.单细胞RNA