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小麦microRNA的鉴定、功能解析与应用潜力挖掘

一、引言

1.1研究背景与意义

小麦（TriticumaestivumL.）作为世界上种植范围最广、历史最悠久的主要粮食作物之一，在全球农业生产和粮食安全中占据着举足轻重的地位。它不仅为人类提供了约20%的膳食能量，还在食品加工、饲料生产等多个领域发挥着不可或缺的作用。中国作为小麦生产和消费大国，其种植面积广泛，涵盖了从寒温带至亚热带的不同生态区域，从北方的春小麦产区到南方的冬小麦产区，小麦的种植适应了多样的气候和土壤条件。例如，在华北平原，冬小麦是主要的粮食作物之一，为当地居民提供了稳定的食物来源；而在东北的黑土地上，春小麦的种植则充分利用了当地的气候特点，保障了区域粮食供应。

在农业生产中，小麦的产量和品质受到多种因素的影响，包括生长发育进程、对生物和非生物胁迫的抗性以及自身的品质形成机制等。深入研究这些过程背后的分子机制，对于培育高产、优质、抗逆性强的小麦新品种具有至关重要的意义。近年来，随着分子生物学和基因组学技术的飞速发展，人们对小麦的遗传信息有了更深入的了解，为从小分子RNA层面揭示小麦生长发育等机制提供了可能。

MicroRNA（miRNA）是一类内源性的非编码小分子RNA，长度通常在20-24个核苷酸之间。在植物中，miRNA通过与靶mRNA的互补配对，介导靶mRNA的切割或抑制其翻译过程，从而在转录后水平对基因表达进行精准调控。miRNA参与了植物生长发育的各个方面，包括种子萌发、根和叶的发育、开花时间的调控、果实成熟等。在小麦中，研究miRNA对于揭示其生长发育的分子机制具有重要价值。例如，在小麦的分蘖过程中，特定的miRNA可能通过调控相关基因的表达，影响分蘖原基的形成和发育，进而决定小麦的分蘖数，而分蘖数是影响小麦产量的关键因素之一。

同时，小麦在生长过程中面临着各种生物胁迫（如病虫害）和非生物胁迫（如干旱、盐碱、低温等）。miRNA在植物应对这些胁迫过程中也发挥着关键作用。一些miRNA能够响应干旱胁迫，通过调控靶基因的表达，增强小麦的抗旱能力，如调节气孔的开闭、影响渗透调节物质的合成等；在应对病虫害时，miRNA可能参与激活植物的防御反应，调控抗病相关基因的表达，增强小麦的抗病性。对小麦miRNA的研究有助于揭示其抗逆的分子机制，为培育抗逆性强的小麦品种提供理论依据。

此外，小麦的品质形成，如蛋白质含量、淀粉品质等，也与miRNA的调控密切相关。不同的miRNA可能参与调控小麦籽粒中蛋白质和淀粉合成相关基因的表达，从而影响小麦的加工品质和营养品质。研究miRNA在小麦品质形成中的作用，对于培育优质小麦品种，满足市场对高品质小麦的需求具有重要意义。

从应用角度来看，对小麦miRNA的深入研究可以为小麦的遗传改良提供新的靶点和策略。通过基因编辑、转基因等现代生物技术手段，调控小麦中关键miRNA及其靶基因的表达，有望培育出具有优良农艺性状的小麦新品种，提高小麦的产量、品质和抗逆性，从而促进农业的可持续发展，保障全球粮食安全。对小麦miRNA的研究在揭示小麦生长发育、抗逆及品质形成的分子机制方面具有重要的理论意义，同时在小麦遗传改良和农业生产中具有巨大的应用价值。

1.2小麦microRNA研究现状

自发现microRNA在植物生长发育和逆境响应中具有重要调控作用以来，小麦microRNA的研究也取得了一系列显著进展。

在小麦microRNA的鉴定方面，随着高通量测序技术的不断发展，研究人员通过构建不同组织、不同发育时期以及不同胁迫条件下的小麦小RNA文库，并进行深度测序，已经鉴定出了大量的小麦microRNA。早期研究利用Sanger测序技术，从有限的小麦样本中鉴定出了一些保守的miRNA；随着第二代测序技术（NGS）的兴起，如Illumina测序平台的广泛应用，能够一次性产生海量的测序数据，大大提高了miRNA的鉴定效率和准确性。通过对测序数据的生物信息学分析，不仅能够鉴定出已知的miRNA，还能发现许多新的小麦特异miRNA。截至目前，在miRBase数据库中已经收录了数百条小麦miRNA序列，这些miRNA序列的鉴定为后续的功能研究奠定了基础。

在功能分析方面，研究表明小麦miRNA参与了众多生理过程的调控。在生长发育方面，如前文所述，miR171通过靶向调控与分蘖发育相关的基因，对小麦分蘖数起到重要的调控作用。过表达miR171的小麦株系分蘖数显著增加，而沉默miR171则导致分蘖数显著减少。在生殖发育过程中，tae-miR408-TaUCL77模块参与了小麦KTM3315A的