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- 2026-02-12 发布于上海
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生物信息分析师考试试卷
一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)
以下哪种文件格式是高通量测序原始数据的标准存储格式?
A.FASTA(三行结构:ID、序列、质量值)
B.BAM(文本格式,包含比对信息)
C.FASTQ(四行结构:序列ID、序列、质量ID、质量值)
D.VCF(存储基因表达量数据)
答案:C
解析:FASTQ是NGS原始数据的标准格式,每行四部分(序列ID、序列、质量标识行、质量值)。A错误,FASTA无质量值;B错误,BAM是SAM的二进制压缩格式;D错误,VCF存储变异信息。
常用于全基因组重测序数据比对的工具是?
A.BWA-MEM
B.Salmon
C.HISAT2
D.MetaPhlAn
答案:A
解析:BWA-MEM是经典的短读长比对工具,适用于基因组重测序。B(Salmon)用于RNA-seq定量;C(HISAT2)用于RNA-seq比对;D(MetaPhlAn)用于宏基因组物种分类。
以下哪个数据库主要存储蛋白质三维结构信息?
A.NCBIGenBank
B.UniProt
C.PDB(ProteinDataBank)
D.Ensembl
答案:C
解析:PDB专门存储蛋白质和核酸的三维结构。A(GenBank)存储核酸序列;B(UniProt)存储蛋白质序列及功能;D(Ensembl)存储基因组注释。
质量值Q30表示测序错误率约为?
A.1%
B.0.1%
C.0.01%
D.10%
答案:B
解析:Phred质量值公式为Q=-10log??(P),Q30对应错误率P=10^(-3)=0.1%。
用于检测单核苷酸变异(SNP)的主流工具是?
A.GATKHaplotypeCaller
B.Canu
C.BLAST
D.DESeq2
答案:A
解析:GATK是变异检测的金标准工具。B(Canu)用于三代测序组装;C(BLAST)用于序列比对;D(DESeq2)用于RNA-seq差异分析。
长读长测序技术(如PacBio)的主要优势是?
A.测序成本低
B.读长更长(可达数万碱基)
C.错误率更低
D.适合小片段文库构建
答案:B
解析:三代测序(如PacBio)的核心优势是超长读长(10-100kb),但错误率较高(~15%),成本也高于二代。
以下哪种工具用于基因功能富集分析?
A.DAVID
B.Trimmomatic
C.Bowtie2
D.SPAdes
答案:A
解析:DAVID是经典的功能富集分析工具,支持GO、KEGG等数据库。B(Trimmomatic)用于质控;C(Bowtie2)用于比对;D(SPAdes)用于基因组组装。
单细胞RNA-seq数据中“UMI(唯一分子标识符)”的主要作用是?
A.减少扩增偏倚
B.提高测序读长
C.增加测序通量
D.降低测序错误率
答案:A
解析:UMI通过标记原始RNA分子,可校正PCR扩增过程中的偏倚,准确定量基因表达。
系统发育树构建中,Bootstrap值(通常取1000次重复)的意义是?
A.表示树的分支长度
B.评估分支的统计学支持度(值越高越可靠)
C.反映物种间的遗传距离
D.标识树的根节点位置
答案:B
解析:Bootstrap值通过重采样评估分支的可信度,通常70表示可信,90表示高度可信。
宏基因组学研究中,“分箱(Binning)”的目的是?
A.去除测序接头
B.将reads组装成contig
C.从混合序列中区分不同微生物的基因组
D.统计物种相对丰度
答案:C
解析:分箱通过序列组成(如GC含量、k-mer频率)或覆盖度差异,将混合的宏基因组序列分配到不同微生物的基因组中。
二、多项选择题(共10题,每题2分,共20分)
以下属于NGS(二代测序)标准分析流程的步骤有?
A.原始数据质量控制(QC)
B.测序读长与参考基因组比对(Mapping)
C.蛋白质三维结构预测
D.基因组变异检测(VariantCalling)
答案:ABD
解析:NGS标准流程包括质控(A)、比对(B)、变异检测(D);C(结构预测)属于蛋白质组学分析,非NGS核心流程。
FASTQ文件质量评估的关键指标包括?
A.平均Phred质量值(如Q20/Q30比例)
B.GC含量分布
C.接头序列污染比例
D.蛋白质分子量
答案:ABC
解析:FASTQ质控关注序列质量(A)、碱基组成(B)、接头污染(C);D(分子量)是蛋白质特性,与核酸无关。
以下可用于三代测序(长读长)基因组组装的工具是?
A.Canu
B.Flye
C.SOAPdenovo
D.SPAdes
答案:AB
解析:Canu和Flye专门优化长读
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