分子动力学简介.pdfVIP

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  • 2026-03-09 发布于河南
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【专业】计算物理【研究方向】分子动力学模拟【学

术讲坛】

1、分子动力学简介:分子动力学方法是一种计算机

模拟实验方法,是研究凝聚态系统的有力工具。该技

术不仅可以得到原子的运动轨迹,还可以观察到原子

运动过程中各种微观细节。它是对理论计算和实验的

有力补充。广泛应用于材料科学、生物物理和药物设

计等。经典MD模拟,其系统规模在一般的计算机上

也可达到数万个原子,模拟时间为纳秒量级。2006年

进行了三千二百亿个原子的模拟(IBMlueGene/L)。

分子动力学总是假定原子的运动服从某种确定的描述,

这种描叙可以牛顿方程、拉格朗日方程或哈密顿方程

所确定的描述,也就是说原子的运动和确定的轨迹联

系在一起。在忽略核子的量子效应和

Born-Oppenheimer绝热近似下,分子动力学的这一种

假设是可行的。所谓绝热近似也就是要求在分子动力

学过程中的每一瞬间电子都处于原子结构的基态。要

进行分子动力学模拟就必须知道原子间的相互作用势。

在分子动力学模拟中,我们一般采用经验势来代替原

子间的相互作用势,如Lennard-Jones势、Mores势、

EAM原子嵌入势、F-S多体势。然而采用经验势必然

丢失了局域电子结构之间存在的强相关作用信息,即

不能得到原子动力学过程中的电子

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