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生物信息学r语言题库及答案

1.在R语言中，用于读取FASTA格式文件的函数是（）（5分）

A.read.table

B.read.fasta

C.readLines

D.scan

2.以下哪个R语言包主要用于序列比对（）（5分）

A.ggplot2

B.Biostrings

C.seqinr

D.DECIPHER

3.已知有一个包含基因表达量数据的data.frame，其中行名是基因名，列名是样本名，要计算每个基因在所有样本中的平均表达量，应该使用以下哪个函数（）（5分）

A.apply

B.tapply

C.rowMeans

D.colMeans

4.在R语言中，如何绘制基因表达量的箱线图（）（5分）

A.plot(x,y)

B.boxplot(x)

C.hist(x)

D.barplot(x)

5.若要对一个基因序列进行反向互补，在R语言中可以使用以下哪个函数（）（5分）

A.reverseComplement

B.revcomp

C.reverse

D.complement

6.已知一个包含SNP位点信息的数据框，其中有两列分别是染色体编号和SNP位点位置，要筛选出位于第3号染色体上位置大于1000000的SNP位点，代码应该是（）（5分）

A.subset(df,chromosome==