2025年宏基因组测序数据质控：AI过滤宿主污染.pptxVIP

第一章宏基因组测序数据质控的挑战与宿主污染问题第二章AI技术在宏基因组数据质控中的应用现状第三章深度学习模型在宿主污染过滤中的原理与应用第四章CNN-LSTM混合模型在宿主污染过滤中的实现与优化第五章模型训练与优化方法详解第六章模型在实际应用中的部署与验证1

01第一章宏基因组测序数据质控的挑战与宿主污染问题

第1页宏基因组测序的广泛应用与数据质控的紧迫需求宏基因组测序技术在现代生物学和医学研究中扮演着至关重要的角色。它能够帮助我们深入了解微生物群落的结构和功能，为疾病诊断、治疗和预防提供科学依据。然而，宏基因组测序数据的质量控制是一个复杂且关键的问题。宿主污染是其中一个主要的挑战，它严重影响了数据的准确性和可靠性。宿主污染是指样本中的人类基因组序列被错误地识别为微生物序列，这在临床样本中尤为常见。研究表明，即使是在严格的实验操作下，宿主污染仍然难以完全避免。因此，如何有效地过滤宿主污染，提高宏基因组测序数据的质控水平，成为了当前研究的热点问题。3

第2页宿主污染的来源与类型分析口腔拭子样本中的宿主污染实验室操作引入的污染PCR实验中的宿主污染控制数据分析阶段的污染特征人类基因组在宏基因组数据中的污染峰图特征样本采集环节的污染风险4

第3页宿主污染的检测方法比较k-mer过滤优点：实现简单；缺点：无法区分宿主与病原体；适用场景：适用于初步筛选基因组比对优点：精度