有参不比对转录组分析流程:Salmon定量与差异表达.pptxVIP

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  • 2026-04-14 发布于北京
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有参不比对转录组分析流程:Salmon定量与差异表达.pptx

12转录组有参分析Salmon流程易生信,毕生缘;培训。

易生信四种常规的转录组分析策略易生信,毕生缘;培训。2Stringtie TrinotateTrinotate (d)不基于比对, 直接定量流程 Reference transcriptHISAT2 Reads Sailfish/kallisto /Salmon-SMEM /Salmon-QuasiAlignment-free isoform quantification counting

易生信有参不比对转录组分析流程易生信,毕生缘;培训。3Sequencing RNA-seq reads(2x150bp)Genequantification Salmon (cDNA)Differentialexpression DESeq2 ImageGPVisualization Gene annotation(.gtffile)(可选)Rawsequence data (.fastqfi

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