样本细分与统计检验方法选择及细胞类型占比分析.pptxVIP

问题：这个序号的排列能不能按照1-15的顺序来，这个图是1,11,12...这个顺序不太连贯，放在图里不太好看。后面这些图的顺序也是这样。在细分和汇总中已经调整

秩和检验卡方检验KW的检验这三个检验方法的结果有所差异，一般是按照哪个检验方法为准呢？检验方法算法和适用情况不同。秩和检验适用于两组的比较。KW检验适用于三组及以上的数据，在这里我们只有两组，是Dunn检验的结果（KW的进一步检验）和秩和检验结果基本是一致的。卡方适用于肿瘤样本，一般非肿瘤和纯免疫数据不用卡方。老师的样本这三种都可以group分组在celltype中细胞占比的检验

这个肿瘤组织和正常组织的细胞数量为什么差这么多啊，每一对肿瘤组织和癌旁组织的细胞数不一样吗？是的，29个样本，15个肿瘤和14个癌旁，样本数不一样，每个样本的细胞数也不一样。单细胞测序主要看比例的差异而不是数量细胞类型占比统计

后续的分析对9个细胞类型进行进一步的亚型分析，着重关注T细胞，髓系细胞（单核巨噬细胞和粒细胞），成纤维细胞，肿瘤细胞，内皮细胞。