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使用genefilter函数从微阵列数据集选基因

介绍

genefilter包可以用于根据多种不同的过滤机制从微阵列数据集中筛选（选择）。在这里，考

虑包中的sample.ExpressionSet示例数据集。该实验包含26个样本，有500因和3个协

变量。这些协变量分别命名为、类型和评分。前两个协变量有两个水平，最后一个协变量是连续的。

类型分数

女性1115

病例对照1511

一个可能对后续分析感的二分法是过滤器是特定的还是非特定的。这里，特定意味着我们是

根据样本元数据进行过滤，例如类型。例如，如果我们想选择在由类型定义的两个组中差异表达的基

，就是一个特定的过滤器。另一方面，如果我们想选择在超过5个样本中表达的，这就是一个

因这

特的过滤器的例子。

非定

首先，让我们看看如何执行一个非特定的过滤。假设我们想要选择在至少5个样本中表达量超过200的