Python文件读写与生物信息学数据处理.pptx

应用Python处理生物信息学数据和作图（二）

Python文件读写(1)为什么要用文件？RAM的特点：读取速度快，但价格昂贵，断电后保存在上面的数据会自动消失磁盘的特点：读取速度比RAM慢，但容量大、费用低廉、断电后可长久保存数据普通文件可以看成是一个文件名下的字节流，把数据从文件读入内存，从内存向磁盘写入文件打开文件读写一个文件前先要打开它：fileobj=open(filename,mode)

Python文件读写(2)打开文件fileobj=open(filename,mode)fileobj是open()函数返回的文件对象filename是文件的字符串名mode指明操作和文件类型操作：r表示读模式，w表示写模式（文件不存在则创建，文件存在则清空重写），a表示追加（若文件存在，在文件末尾追加写入）、x表示文件不存在时创建新文件写入（文件存在则报错）文件类型：默认为t，t表示以文本文件方式操作，b表示以二进制文件方式操作

Python文件读写(3)写入文件protein_sequence=NADkinaseisoform1[Homosapiens]...MEMEQEKMTMNKELSPDAAAYCCSACHGDETWSYNHPIRGRAKSRSLSASPALGSTKEFRRTRSLHGPCP...VTTFGPKACVLQNPQTIMHIQDPASQR