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生物信息数据并行处理：算法、应用与挑战

一、引言

1.1研究背景与意义

生物信息学作为一门融合了生物学、计算机科学、数学和统计学等多学科知识的交叉学科，在现代生命科学研究中扮演着举足轻重的角色。自20世纪90年代人类基因组计划启动以来，生物数据以前所未有的速度增长。据统计，GenBank数据库中的碱基对数量从最初的寥寥无几增长到如今的数万亿，且仍在持续快速积累。这些数据涵盖了基因序列、蛋白质结构、基因表达谱等多个层面，为揭示生命奥秘提供了丰富的素材，但同时也带来了巨大的计算挑战。

传统的单机计算模式在处理大规模生物信息数据时显得力不从心。以基因组序列比对为例，这是生物信息学中最基