差异基因分析理论与实践：化方法及其重要性.pptxVIP

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易生信差异基因分析的几个问题???什么是差异基因分析？ 不同组间稳定表达差异的基因筛选为什么要做差异基因分析？ 筛选靶点怎么做差异基因分析？ 标准化 统计差异检测 统计筛选易生信，毕生缘；培训。2

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易生信基因表达标准化??不同样品的测序量会有差异，最简单的标准化方式是计算countspermillion(CPM)，即每个样品基因的原始readscount除以样品总可用reads数乘以1,000,000。缺点是容易受到极高表达且在不同样品中存在差异表达的基因的影响；这些基因的打开或关闭会影响到细胞中总的分子数目，可能导致这些基因标准化之后就不存在表达差异了，而原本没有差异的基因标准化之后却有差异了。易生信，毕生缘；培训。4

易生信DESeq2:量化因子标准化易生信，毕生缘；培训。5 RNA-seq reads(2x150bp)SequencingSalmon (cDNA)DESeq2Differentialexpression ImageGPVisualization Geneannotation (.gtffile)Rawsequence data (.fastqfiles)CDNAfile (.fafile) InputsGO/GSEAEn