CN119724381A 酶反应中间态复合物自动化分子动力学模拟方法及系统 （微观纪元(合肥)量子科技有限公司）.docxVIP

(19)国家知识产权局

(12)发明专利申请

(10)申请公布号CN119724381A

(43)申请公布日2025.03.28

(21)申请号202510238211.7

(22)申请日2025.03.03

(71)申请人微观纪元（合肥）量子科技有限公司

地址230000安徽省合肥市高新区望江西

路5089号中国科学技术大学先进技术

研究院嵌入式研发楼218

(72)发明人徐敏捷蒲中机管佳明来关学耿威吕川

(51)Int.Cl.

G16C10/00(2019.01)

G16C20/50(2019.01)

权利要求书3页说明书11页附图9页

(54)发明名称

酶反应中间态复合物自动化分子动力学模

拟方法及系统

(57)摘要

CN119724381A本公开涉及一种酶反应中间态复合物自动化分子动力学模拟方法及系统，该方法包括：获取包含P450酶的蛋白配体结构文件，解析得到血红素结构文件、普通配体结构文件以及纯蛋白结构文件并进行预处理；基于获取的突变设置文件对纯蛋白结构文件进行突变，并进行第二次预处理；基于量子力学QM计算结果文件，修改纯蛋白结构文件以及血红素结构文件，得到中间态纯蛋白结构文件和中间态血红素结构文件，基于中间态纯蛋白结构文件、中间态血红素结构文件和普通配体结构文件组装得到分子动力学模拟输入文件；构建分子动力