转录组学分析操作标准流程｜分步拆解 + 易错点规避.pptx

1原始下机数据预处理演讲人

原始下机数据预处理01参考序列比对与转录本组装02差异表达分析与功能富集04结果验证与数据归档05表达定量与样本质量再评估03目录

转录组学分析操作标准流程｜分步拆解+易错点规避

各位从事转录组研究的同行、同学们，我从事转录组学数据分析与方法开发工作已有八年，经手过从模式生物基础研究到临床肿瘤样本队列分析的上百个项目，在这个过程中我发现，哪怕是有一定生信基础的研究者，也经常会因为流程不规范、忽略细节陷阱，得到不可重复甚至错误的结论，最终耽误研究进度。今天我将结合自身的实践经验，全面拆解转录组分析的标准操作流程，逐一标注每个环节的常见易错点，帮助大家建立规范可重复的分析思路。接下来我将按照分析的先后顺序，逐步展开讲解。

01原始下机数据预处理

原始下机数据预处理转录组分析的基础是高质量的cleandata，测序下机得到的原始数据不可避免存在接头残留、低质量碱基、污染序列等问题，这一步的处理质量直接决定了后续所有结果的可靠性，绝对不能省略。我曾经在项目初期就吃过这个亏，当时直接使用测序公司返回的cleandata进行分析，最终差异基因列表中近15%的差异基因来自接头污染区域，后续qPCR全部验证不出来，返工整整花了两周时间。

1原始数据基础质控与修剪1.1质控统计第一步需要对原始下机数据的碱基质量、接头残留、GC分布等指标进行统计，目前通用工