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2017-2018年中国部分地区猪流行性腹泻病毒（PEDV）遗传演化特征剖析

一、引言

1.1研究背景

猪流行性腹泻病毒（PorcineEpidemicDiarrheaVirus，PEDV）属于冠状病毒科α冠状病毒属，是引发猪流行性腹泻（PorcineEpidemicDiarrhea，PED）的病原体。该病是一种对猪具有高度接触传染性的肠道疾病，主要临床症状表现为呕吐、严重腹泻以及脱水，尤其对新生仔猪危害极大，可导致其死亡率高达80%-100%。PEDV通过粪口途径迅速传播，给全球养猪业造成了极为严重的经济损失。自1971年在英国首次被发现并于6年后成功分离得到经典病毒毒株CV777以来，PEDV在世界范围内不断传播扩散。2010年，PEDV变异毒株在中国出现，随后于2013-2014年在欧美地区流行，给当地养猪业带来沉重打击。尽管美国在2015年基本控制住了疫情，但在中国，PEDV至今仍持续流行，防控形势极为严峻。

2017-2018年期间，中国养猪业遭受了PEDV的严重冲击。从流行病学调查数据来看，多地猪场出现了PEDV感染病例，且感染率和发病率均处于较高水平。例如，对2017年中国大陆地区的检测数据显示，在2055份检测样品中，阳性率高达58.8%，对其中230份阳性样品进一步检测发现，