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基于图神经网络的药物配伍预测结题报告

一、研究背景与问题提出

药物配伍是临床治疗和新药研发中的关键环节，合理的药物组合能够显著提升治疗效果、降低单药毒副作用，甚至攻克单一药物难以应对的复杂疾病。然而，传统的药物配伍研究主要依赖于体外实验、临床试验和专家经验，存在周期长、成本高、效率低等问题。据统计，一款新药从研发到上市平均需要10-15年时间，成本超过26亿美元，其中药物配伍筛选阶段往往占据了大量的时间和资源。

随着生物医学数据的爆炸式增长，尤其是组学数据、药物-靶点相互作用数据、临床电子病历数据的积累，如何利用人工智能技术从海量数据中挖掘潜在的药物配伍规律，成为了当前生物医药领域的研究热点。图神经网络（GraphNeuralNetworks,GNNs）作为一种能够有效处理图结构数据的深度学习模型，为药物配伍预测提供了新的思路。药物、靶点、疾病等生物实体及其相互作用天然构成了复杂的图结构，GNNs能够通过学习图中节点和边的特征，捕捉生物实体之间的潜在关联，从而实现对药物配伍效果的准确预测。

然而，当前基于GNN的药物配伍预测研究仍面临诸多挑战：首先，生物医学数据存在高噪声、高维度、不完整等问题，如何对这些数据进行有效的预处理和特征表示，是提升模型性能的关键；其次，药物配伍的作用机制复杂，涉及多靶点、多通路的协同作用，现有的GNN模型大多只能捕捉局部的图结构信息，难以建模全局的