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基于图神经网络的药物重定位结题报告

一、研究背景与问题提出

药物研发是一个周期长、成本高、风险大的过程，据统计，一款全新药物从研发到上市平均需要10-15年时间，成本超过26亿美元，且成功率不足10%。在这样的背景下，药物重定位（DrugRepurposing）逐渐成为生物医药领域的研究热点。药物重定位指的是将已批准上市的药物用于治疗新的疾病，或者发现现有药物的新适应症。与传统药物研发相比，药物重定位具有研发周期短、成本低、成功率高的显著优势，因为已上市药物的安全性和药代动力学特性已经经过了临床试验和市场验证。

然而，传统的药物重定位方法存在诸多局限性。实验筛选方法依赖于大规模的湿实验，不仅耗时费力，而且难以全面覆盖所有可能的药物-疾病组合。基于机器学习的计算方法虽然在一定程度上提高了效率，但大多采用传统的机器学习模型，如支持向量机、随机森林等，这些模型难以有效处理药物-疾病相互作用中的复杂非线性关系和多模态数据。随着生物信息学的快速发展，大量的生物医学数据不断涌现，包括药物分子结构数据、基因表达数据、蛋白质相互作用数据、疾病表型数据等，如何从这些海量、高维、异质的数据中挖掘出潜在的药物-疾病关联，成为药物重定位研究面临的关键问题。

图神经网络（GraphNeuralNetworks,GNNs）作为一种新兴的深度学习模型，为解决上述问题提供了新的思路。图神经网络能够直接处理