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基于扩散生成模型的分子设计方法结题报告

一、研究背景与问题提出

在药物研发、材料科学等领域，分子设计是核心环节之一。传统的分子设计方法主要依赖于化学家的经验积累、高通量筛选以及基于规则的分子生成策略。然而，这些方法存在诸多局限性：高通量筛选依赖于庞大的化合物库，不仅成本高昂、周期漫长，而且容易陷入“局部最优”的困境，难以突破现有分子结构的束缚；基于规则的方法则过度依赖人工定义的规则体系，灵活性不足，无法充分挖掘化学空间的多样性。

随着人工智能技术的快速发展，机器学习模型在分子设计领域的应用逐渐成为研究热点。其中，扩散生成模型作为一种新兴的生成式模型，凭借其强大的建模能力和对复杂分布的拟合能力，为分子设计带来了新的思路。扩散生成模型通过模拟一个逐渐向数据中添加噪声的正向过程，以及一个从噪声中逐步恢复数据的反向过程，能够学习到数据的真实分布，从而生成高质量、多样化的样本。将扩散生成模型应用于分子设计，有望突破传统方法的瓶颈，实现高效、精准的分子生成。

本研究旨在探索基于扩散生成模型的分子设计方法，解决传统分子设计方法存在的效率低、多样性不足等问题，为药物研发和材料设计提供新的技术手段。

二、扩散生成模型原理与适配改造

（一）扩散生成模型基本原理

扩散生成模型的核心思想源于非平衡热力学，其主要包含正向扩散过程和反向扩散过程两个部分。

在正向扩散过程中，模型会逐步向原始分子数据中添加高斯噪