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ctDNA片段分析服务规范

一、样本采集与预处理规范

ctDNA片段分析的质量控制需从样本采集环节开始严格把控。样本采集应使用含细胞稳定剂的专用抗凝管（如Streck管），避免血液样本在运输和处理过程中因细胞裂解释放基因组DNA，导致ctDNA纯度降低。采集后需在4℃条件下2小时内完成血浆分离，推荐采用两步离心法：首先以1600×g离心10分钟分离血浆，随后取上层血浆以16000×g再次离心10分钟，彻底去除残留血细胞。分离后的血浆应在24小时内完成cfDNA提取，若无法及时检测，需置于-80℃冰箱保存，且冻融次数不得超过3次，以防DNA片段降解。

对于特殊样本类型（如胸腔积液、腹水等），需在采集后1小时内进行离心处理，1500×g离心15分钟取上清液，后续处理流程参照血浆样本标准。样本标签需包含唯一标识符、采集时间、患者基本信息等关键要素，且全程采用冷链运输（0-4℃），运输过程中需实时监控温度并记录，确保样本质量可追溯。

二、ctDNA提取与质控标准

ctDNA提取应采用经临床验证的商业化试剂盒，优先选择磁珠法或柱提法，提取过程需在生物安全柜内进行，严格遵循无菌操作规范。提取后的cfDNA需通过多重质控指标评估质量：

浓度检测：使用荧光定量法（如Qubit）测定DNA浓度，要求血浆样本提取浓度不低于1ng/μL，总提取量不低于20ng；

片段分布分析：通过毛细管电泳（如Ag