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基于图神经网络的分子性质可解释预测结题报告

一、研究背景与问题提出

在药物研发、材料科学等领域，分子性质的精准预测是推动创新的核心环节。传统实验方法虽然能准确测定分子性质，但存在周期长、成本高、效率低等问题，难以满足现代研发对海量分子快速筛选的需求。随着计算化学和人工智能技术的发展，机器学习模型逐渐成为分子性质预测的重要工具。

早期的机器学习模型，如支持向量机（SVM）、随机森林（RF）等，在处理分子数据时通常需要将分子结构转换为固定长度的指纹向量。然而，这种转换方式往往会丢失分子的空间结构信息，导致模型对分子性质的预测能力受限。近年来，图神经网络（GNN）的兴起为分子性质预测带来了新的突破。GNN能够直接以分子的图结构作为输入，通过学习节点（原子）和边（化学键）的特征，有效捕捉分子的结构信息，从而实现更精准的性质预测。

尽管GNN在分子性质预测任务中取得了显著的成果，但大多数模型仍然是“黑箱”模型，缺乏可解释性。在药物研发等关键领域，模型的预测结果不仅需要准确，还需要能够解释预测的依据，以便研究人员理解分子结构与性质之间的关系，进而指导分子设计和优化。因此，如何提高GNN在分子性质预测中的可解释性，成为当前研究的重要挑战。

二、研究目标与内容

（一）研究目标

本研究旨在构建一种基于图神经网络的分子性质可解释预测模型，实现以下目标：

提高分子性质预测的准确性，达到或超过现有先进模型