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基于图注意力的药物分布预测结题报告

一、研究背景与问题提出

药物在体内的分布过程是药代动力学的核心研究内容之一，直接决定了药物在靶器官的有效浓度，进而影响治疗效果与毒副作用。传统的药物分布预测方法主要依赖于动物实验、生理药代动力学（PBPK）模型以及基于分子描述符的机器学习模型。然而，这些方法存在明显局限性：动物实验周期长、成本高，且物种间差异可能导致结果外推至人类时出现偏差；PBPK模型需要大量生理参数，对于结构新颖的药物适应性差；传统机器学习模型难以捕捉分子间复杂的相互作用关系，尤其是药物与生物大分子（如蛋白质、核酸）之间的动态结合过程。

随着人工智能技术的快速发展，图神经网络（GNN）为药物分子建模提供了新的思路。药物分子天然具有图结构，原子作为节点，化学键作为边，能够精准表征分子的三维拓扑信息。图注意力网络（GAT）作为GNN的重要分支，通过引入注意力机制，能够自适应地学习不同节点间的关联权重，有效捕捉分子局部结构与全局性质之间的联系。本研究旨在构建基于图注意力的药物分布预测模型，突破传统方法的瓶颈，实现更精准、高效的药物分布预测。

二、数据集构建与预处理

2.1数据集来源

本研究整合了多个公开数据库的药物分布相关数据，包括：

ChEMBL数据库：获取了1200余种小分子药物的人体组织分布数据，涵盖血浆蛋白结合率、组织-血浆分配系数等关键指标。

DrugBank数据库：补