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基于图注意力的药物遗传毒性预测结题报告

一、研究背景与问题提出

药物研发是一个高投入、高风险、长周期的过程，其中药物安全性评价是决定药物能否成功上市的关键环节。遗传毒性作为药物安全性评价的重要指标之一，指的是药物或其代谢产物对生物体遗传物质（如DNA）造成损伤，进而可能引发基因突变、染色体畸变等遗传异常，甚至导致癌症、出生缺陷等严重后果。据统计，约30%的药物研发失败案例与药物的遗传毒性密切相关，因此在药物研发早期阶段准确预测药物的遗传毒性，对于降低研发成本、缩短研发周期、保障公众健康具有重要意义。

传统的药物遗传毒性预测方法主要包括体内实验和体外实验。体内实验如小鼠微核试验、大鼠显性致死试验等，能够较为真实地反映药物在生物体内的遗传毒性情况，但存在实验周期长、成本高、动物伦理争议等问题。体外实验如Ames试验、体外染色体畸变试验等，虽然实验周期相对较短、成本较低，但往往难以完全模拟生物体内复杂的生理环境，导致预测结果的准确性和可靠性受到一定限制。

随着计算机技术和人工智能的快速发展，基于机器学习和深度学习的计算毒理学方法逐渐成为药物遗传毒性预测的研究热点。与传统实验方法相比，计算毒理学方法具有快速、高效、低成本等优势，能够在药物研发早期对大量化合物进行筛选和评估。然而，现有的计算毒理学方法大多基于化合物的二维结构信息（如分子指纹、分子描述符等）进行建模，忽略了化合物的三维空间结构