基因测序，解读天书——基因测序分析师的年终总结.docVIP

基因测序，解读天书——基因测序分析师的年终总结

测序仪的荧光信号在实验室的暗室里闪烁了365天，我面前的分析队列里还躺着最后3份2026年的临床全外显子组测序样本。今年实验室累计完成12760例测序分析任务，其中罕见病诊断样本4217例，肿瘤伴随诊断样本5832例，健康风险筛查样本2021例，科研合作样本690例，整体分析准确率达到99.92%，比去年提升了0.07个百分点。这串数字背后是312例罕见病患儿的明确诊断，是2146例肿瘤患者获得精准用药方案的依据，是127个家庭避免了再发遗传病的风险，也是我作为基因测序分析师一年来最厚重的工作注脚。

今年第一季度处理的一例脊髓性肌萎缩症（SMA）疑似病例让我印象格外深刻。患儿只有10个月大，已经出现了明显的肌张力减退和运动发育迟缓，外院临床高度怀疑SMA，但常规PCR检测只发现SMN1基因外显子7的杂合缺失，按照常规诊断标准无法确诊，临床医生把样本送到我们实验室做补充测序分析。拿到下机数据的第一时间，我先核对了测序深度：SMN1基因区域的平均测序深度达到287×，覆盖度100%，不存在大片段缺失漏检的可能。接下来比对SMN1和SMN2的同源序列时，我发现常规分析流程默认过滤的一个位于外显子7剪接位点的单核苷酸变异（SNV），恰恰出现在患儿仅存的那条SMN1等位基因上。这个变异的频率在人群数据库里只有0.0012%，之前没有被正式列入致