基于基因组学的龙眼MADS转录因子的生物信息学分析.docx

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摘要

MADS-box主要存在于真核生物中，隶属于进化程度上高度保守的一类基因家族，对果实成熟相关基因的启动子进行调控。本文以龙眼MADS转录因子为研究对象，通过ExPASy、MEGA5.0、MEME等各种在线软件对龙眼的氨基酸组成、蛋白序列比对、motif预测、基因结构的相关鉴定以及其他理化性质分析。从龙眼基因组中比对出87个MADS蛋白质，初步筛选出50个龙眼MADS基因家族成员，该基因家族中大部分为不稳定性亲水蛋白，并且所有DlMADS-box家族成员均含有motif1。在启动子区域顺式作用元件分析中光响应元件存在