序列计数数据差异表达分析方法.pdfVIP

Anders与Huber组生物学2010年，11:R106

方

法开放获取s

序列计数数据的差异表达分析

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西蒙·安德斯，

RNA、ChIP或条形码计数等高通量技术以计数数据形式定量读值。要正确且具有良好统

计功效地推断此类数据中的差异信号，需要动态范围内数据变异性的准确估计及合适的误差模型。我们提

出一种基于负二项分布的方法，通过局部回归将方差与均值关联，并实现为R/Bioconductor软件包

DESeq。

背景将服从多项式分布，该分布可通过泊松分布近似模拟。

片段的高通量技术被广泛应用于各类定量分

析。这些分析方法的共同特征在于，它们对大量因此，泊松分布曾被用于差异表达检验[6,7]。该

片段进行，这些片段分别反映了生物系统的分布仅有一个参数，由其均值唯一确定；其方差及其

RNA分子库（如RNA‑Seq[1,2]）或结合分子的他特性皆由