微生物基因组学.ppt

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生物降解作用 Deinococcus radiodurans:抵御放射性物质 Thermotoga maritima:降解单体或复合植物 聚合物, 如木聚糖和纤维素 Dehalococcoides ethenogenes:降解四氯乙烯 Pseudomonas putida:降解多种毒性有机废料, 包括多种芳香族化合物 酶工业 Thermotoga maritima:耐热 Aquifex aeolicus:耐热 Methanogenium frigidum:耐寒 Halobacterium:耐盐,降解塑料 Pseudomonas putida:降解塑料 食品生物技术 Lactococcus latis: 生产发酵食品,微生物营养添加剂 抗生物质 Streptomyces coelicolor: 生产抗生素,用于人类,兽医和农业 Photorhabdus luminescens: Bacillus thuringiensis Xenorhabdus nematophilus 产生杀昆虫毒素蛋白 转基因抗昆虫植物 C 微生物的进化 基于16S rDNA的系统进化树: Woese等的生物 三域-- 真细菌域、古生菌域和真核生物域 单个基因的进化并不等同于物种的进化 --基因的水平转移 基因的水平转移 的意义 研究微生物的进化史 研究菌种新功能的来源 研究微生物的生命过程 预测基因功能 基因水平转移的方式 转化 接合 转导 鉴定基因水平转移的方法 鉴定基因组区段的组成 比较不同基因的系统发生 最大相似性分析 基因在生物的分布谱 易被水平转移的基因 难被转移的基因:informational genes 进化核心基因 易被转移的基因:operational genes 氨酰-tRNA合成酶基因 剪切因子 重组酶 DNA聚合酶 基因水平转移分析的例子 嗜热真细菌: Aquifex aeolicus Thermotoga maritima 病原菌基因组: 大肠杆菌 Xylella fastidiosa 整个遗传因子的转移 Borrelia 的线性质粒 V. cholerae的小染色体 质粒 Thanks E-mail: husn@ 本文来自网络,请不要使用盗版文档,尊重作者的辛苦劳动,谢谢 G 我爱朱丹老婆 20100808080808080808080808080808080808080808080808080808080808080 Lvdd我爱你ZDLP 重复序列- Largest families of paralogous genes Family Number of genes (total 312) (total 853) ATP-binding subunits of ABC transporters 23 Reductases/dehydrogenases 12 Two-component system, regulatory proteins 12 Hypothetical proteins

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